MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4403451626 · doi:10.1021/jacs.4c11648

Rapid Systematic Screening of Bispecific Antibody Surrogate Geometries for T-Cell Engagement Using DNA Nanotechnology

2024· article· en· W4403451626 sur OpenAlexafffund
Sabrine Messaoudi, Kevin Wai, April Marple, Seyed Farzad Baniahmad, Ryan G. Wylie, M Pelletier, Morgan Craig, Yves Durocher, Andrea A. Greschner, Marc A. Gauthier

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineNational Research Council CanadaMcMaster UniversityInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaProstate Cancer CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésChemistryBispecific antibodyNanotechnologyDNAAntibodyMonoclonal antibodyImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bispecific antibodies (bsAbs) are emerging immune-therapeutics, and many formats exist that differ considerably in structure. However, little systematic data exist about how the spatial organization of their components influences activity, requiring innovative approaches combining empirical and quantitative frameworks. This study presents a modular DNA nanotechnology platform to generate numerous bsAbs with surrogate geometries that span the structural features of the BiTE, IgG-like, and IgG-conjugate platforms to screen for T-cell engagement. Results highlight interesting structure-activity relationships regarding bsAb potency and selectivity and raise questions regarding the molecular phenomena underlying activity. To elucidate some effects, the platform was paired with a simple mathematical model. This work is thus one of the first to systematically investigate and reveal the importance of the spatial organization of bsAb components on activity and equally provides an accessible and convenient tool for rapidly mapping out such trends for other combinations of target epitopes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Chemical Society→Même sujetMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research→Travaux en français237 207→