MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4403482142 · doi:10.1101/2024.10.15.618412

Parameter Dependence in Identifiability Applied to FP-Fisher-KPP Reaction-Diffusion Equations Parameterized for Tauopathy Network Modeling

2024· preprint· en· W4403482142 sur OpenAlexaff
Arsalan Rahimabadi, Habib Benali

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene Regulatory Network Analysis
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIdentifiabilityParameterized complexityTauopathyDiffusionApplied mathematicsMathematicsPhysicsStatisticsCombinatoricsThermodynamics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parameterization and a priori identifiability analysis are two interconnected steps that should be carried out in advance of model calibration. In the first place, we propose a framework for parameterizing a recently introduced and analytically studied generalization of the celebrated Fisher-Kolmogorov-Petrovsky-Piskunov (Fisher-KPP) reaction-diffusion (Re-Di) equation with fractional polynomial (FP) terms to model heterogeneous nonlinear diffusion in the propagation of a given species through directed networks, exemplified by the tauopathy progression in Alzheimer's disease (AD). Next, we present our results on identifiability in a generic sense for the parameterized FP-Fisher-KPP Re-Di equations with regular multi-experimental designs, seamlessly applicable to meromorphic systems, encompassing analytic systems. In particular, the concept of generic local minimal dependence of unknown parameters and regularly parameterized initial conditions will be formalized through the use of one-parameter Lie groups of transformations, and a decomposition method to explore this new concept will be devised. Finally, the Allen Mouse Brain Connectivity Atlas (AMBCA) dataset is utilized to develop a model for tauopathy progression in the mouse brain, which will subsequently be employed to implement the proposed methodology for analyzing a priori identifiability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,543
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetGene Regulatory Network AnalysisTravaux en français237 207