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Enregistrement W4403486661 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-24-2105

Genomic Landscape of ctDNA and Real-World Outcomes in Advanced Endometrial Cancer

2024· article· en· W4403486661 sur OpenAlexaff
Pamela Soberanis Pina, Keelia Clemens, Adrian Bubie, Brooke Grant, G. Clark Haynes, Nicole Zhang, Leylah Drusbosky, Stéphanie Lheureux

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASPTENMedicineOncologyInternal medicineMutationCancerARID1AEndometrial cancerCohortGermline mutationRetrospective cohort studyCancer researchGeneColorectal cancerGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: ctDNA is a novel technique extensively studied in solid tumors, although not currently well defined in endometrial cancer. EXPERIMENTAL DESIGN: A de-identified retrospective analysis of 1,988 patients with advanced/recurrent endometrial cancer was performed. In addition, an analysis of a real-world evidence cohort was completed (n = 1,266). Patients underwent ctDNA testing using Guardant360 during routine clinical care. The objective was to describe and assess molecular landscape using ctDNA. RESULTS: Among 1,988 ctDNA samples, at least one somatic alteration was detected in 91.6% (n = 1,821). Most frequently altered genes were TP53 (64%), PIK3CA (29%), PTEN (25%), ARID1A (20%), and KRAS (14%). Overall, 18.5% had amplifications, with the majority identified in CCNE1 (40.9%), PIK3CA (22%), and EGFR (19.3%). From the real-world evidence cohort, those with TP53 mutations had a worse overall survival (OS) versus those without TP53 mutations (P = 0.02) and those with TP53 comutations had an inferior OS in comparison with TP53-mutated only (P = 0.016). Amongst these, patients with a PIK3CA comutation (P = 0.012) and CCNE1 amplification (P = 0.01) had an inferior OS compared with those with only TP53 mutations. Fifty-seven patients with newly diagnosed endometrial cancer had at least two serial ctDNA samples showing evolution in detected variants compared with baseline samples, with TP53 being the most frequent change. CONCLUSIONS: This study is one of the largest cohorts of ctDNA currently reported in endometrial cancer. The presence of TP53 mutation and other comutations detected by ctDNA have a negative effect on outcomes. This report suggests that ctDNA analysis is feasible and could become a useful biomarker for endometrial cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,195
Score d'incertitude au seuil0,629

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,501
Écart entre enseignants0,396 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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