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Enregistrement W4403495001 · doi:10.26434/chemrxiv-2024-qn66k

High-purity single-molecule modification of carbon nanotubes by stochastic distribution of DNA

2024· preprint· en· W4403495001 sur OpenAlexfundno aff
Shoichi Nishitani, Markita P. Landry

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPhilomathia FoundationBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésCarbon nanotubeDNAMoleculeNanotechnologyDistribution (mathematics)Materials scienceChemical engineeringChemistryOrganic chemistryMathematicsEngineeringBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Single-walled carbon nanotubes (SWCNTs) show promise for probing molecular interactions at single-molecule resolution, but precise and uniform surface modifications needed for single-molecule SWCNT applications remain challenging due to the stochastic nature of chemical reactions. This study presents a batch-scale synthesis and separation of single-molecule modified SWCNTs, leveraging the stochastic distribution of single-stranded DNA (ssDNA) on SWCNTs and biology-inspired separation strategies. Specifically, SWCNTs were dispersed with ssDNA mixed with a small fraction of decorated ssDNA (m-ssDNA). We developed a stochastic ssDNA-SWCNT binding model to predict the distribution of ssDNA and m-ssDNA on SWCNT at distinct mixing ratios and successfully implemented our model to produce SWCNT nanoparticles predominately containing only one m-ssDNA tag. These singly modified SWCNTs were isolated from unmodified SWCNTs using magnetic bead exploiting biotin-streptavidin interactions, achieving 0.05 μg yield at 0.25% m-ssDNA ratio, corresponding to 97.6% purity of singly modified populations. Finally, the single-molecule modification at the predicted m-ssDNA ratios was confirmed using a fluorophore as a model, enabling precise determination of SWCNT molar concentration. Ultimately, our approach provides a batch-scale method for incorporating a single molecular tag per SWCNT, supporting diverse future applications in SWCNT-based nanotechnologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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