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Enregistrement W4403501526 · doi:10.3389/fnagi.2024.1406573

Systematic review and meta-analysis of the association between ABCA7 common variants and Alzheimer’s disease in non-Hispanic White and Asian cohorts

2024· review· en· W4403501526 sur OpenAlexaboutno aff
Da Liu, Hongwei Zhang, Liu Cao, Jianyu Liu, Yan Liu, Na Bai, Qiang Zhou, Zhiyao Xu, Linyan Li, Hua Liu

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Aging Neuroscience · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeta-analysisSingle-nucleotide polymorphismPublication biasOdds ratioOncologyFunnel plotConfidence intervalInternal medicineMedicineGenotypeBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and aims The relationship between the ABCA7 gene and Alzheimer’s disease (AD) has been widely studied across various populations. However, the results have been inconsistent. This meta-analysis aimed to evaluate the association of ABCA7 polymorphisms with AD risk, including specific subtypes such as late-onset Alzheimer’s disease (LOAD). Methods Relevant studies were identified through comprehensive database searches, and the quality of each study was assessed using the Newcastle-Ottawa Scale (NOS). Allele and genotype frequencies were extracted from the included studies. The pooled odds ratios (OR) with corresponding 95% confidence intervals (CI) were calculated using random-effects or fixed-effects models. Multiple testing corrections were conducted using the false discovery rate (FDR) method. The Cochran Q statistic and I2 metric were used to evaluate heterogeneity between studies, while Egger’s test and funnel plots were employed to assess publication bias. Results A total of 36 studies, covering 21 polymorphisms and involving 31,809 AD cases and 44,994 controls, were included in this meta-analysis. NOS scores ranged from 7 to 9, indicating high-quality studies. A total of 11 SNPs (rs3764650, rs3752246, rs4147929, rs3752232, rs3752243, rs3764645, rs4147934, rs200538373, rs4147914, rs4147915, and rs115550680) in ABCA7 were significantly associated with AD risk. Among these SNPs, two (rs3764650 and rs3752246) were also found to be related to the late-onset AD (LOAD) subtype. In addition, two SNPs (rs4147929 and rs4147934) were associated with the susceptibility to AD only in non-Hispanic White populations. A total of 10 SNPs (rs3764647, rs3752229, rs3752237, rs4147932, rs113809142, rs3745842, rs3752239, rs4147918, rs74176364, and rs117187003) showed no significant relationship with AD risk. Sensitivity analyses confirmed the reliability of the original results, and heterogeneity was largely attributed to deviations from Hardy–Weinberg equilibrium, ethnicity, and variations between individual studies. Conclusion The available evidence suggests that specific ABCA7 SNPs may be associated with AD risk. Future studies with larger sample sizes will be necessary to confirm these results. Systematic review registration https://www.crd.york.ac.uk/prospero/ , identifier: CRD42024540539.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,033
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,075

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,033
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0180,038
Bibliométrie0,0100,011
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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