Rapid promoter evolution of male accessory gland genes is accompanied by divergent expression in closely related <i>Drosophila</i> species
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Seminal fluid proteins (Sfps) are essential for reproductive success and evolve fast, possibly driven by post-copulatory sexual selection (PCSS) originating from sperm competition and cryptic female choice. Counterintuitively, however, the coding region only in few Sfps evolves adaptively. Hence, additional genomic and functional factors must play a role in Sfp evolution independent of the protein coding region. To shed light on drivers of Sfp evolution we focus on those Sfps predominantly expressed in male accessory glands, because this allows examination of their evolution in the tissue which produces the majority of Sfps. Moreover, accessory glands develop normally in hybrids in contrast to testis allowing to control for changes in cellular environment arising during speciation. Here, we discover that Acp promoters contain hot spots for rapid evolution from accumulation of sequence changes and insertions/deletions (indels). We further show that changes in promoter sequences are accompanied by gene expression divergence among closely related Drosophila species. We then validate these observations in Drosophila hybrids to show that species-specific expression divergence of Acps with rapidly evolving promoters are maintained in hybrids for some Acps, while others show dominance of one allele, a phenomenon termed transvection. These results indicate that cis -regulatory evolution, rather than genome background variation, drives Acp expression changes and promotes their rapid evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».