The frequency of HLA-DQ7 in patients at risk of coeliac disease: A haplotype to be reckoned with for screening?
Notice bibliographique
Résumé
HLA-DQ2 and -DQ8 carriers are genetically predisposed to develop coeliac disease (CD). Testing negative for HLA-DQ2/DQ8 has a high negative predictive value. Full HLA-DQ genotyping as well as tests only typing for HLA-DQ2/DQ8 are therefore used for screening at-risk populations. However, HLA-DQ7 positive and HLA-DQ2/DQ8 negative CD patients have been described in various populations. In this study we examine the relevance for HLA-DQ7 typing in a large at-risk CD population. The HLA-DQ status of all paediatric and adult patients at-risk of CD that were typed in a tertiary medical centre laboratory between 2012 and 2016 (n = 3983) was obtained. HLA-DQ7 (HLA-DQB1*03:01) positive and HLA-DQ2/DQ8 negative patients were selected. We gathered information on serology, histology and dietary status, and CD diagnosis. In total, 489/3983 patients were HLA-DQ7-positive and HLA-DQ2/DQ8 negative, and after exclusion (missing data on diet or serology/histology), 325 were included. Only one adult patient was diagnosed with CD, based on a duodenal biopsy and a clinical response to a gluten-free diet. Homozygosity was observed in 14.8 %. Based on the current cohort additional typing of HLA-DQ7 does not seem relevant for screening at-risk populations for CD in the Netherlands. It should be considered in patients with a high suspicion of CD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».