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Enregistrement W4403511310 · doi:10.1080/15592294.2024.2413815

Epigenome-wide meta-analysis of prenatal vitamin D insufficiency and cord blood DNA methylation

2024· review· en· W4403511310 sur OpenAlexaff
Elizabeth W. Diemer, Johanna Tuhkanen, Sara Sammallahti, Kati Heinonen, Alexander Neumann, Sonia L. Robinson, Matthew Suderman, Jianping Jin, Christian M. Page, Ruby Fore, Sheryl L. Rifas‐Shiman, Emily Oken, Patrice Perron, Luigi Bouchard, Marie‐France Hivert, Katri Räikköne, Jari Lahti, Edwina Yeung, Weihua Guan, Sunni L. Mumford, Maria C. Magnus, Siri E. Håberg, Wenche Nystad, Christine L Parr, Stephanie J. London, Janine F. Felix, Henning Tiemeier

Notice bibliographique

RevueEpigenetics · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeJewish General Hospital
Organismes subventionnairesIntramural Research ProgramNational Institute of Child Health and Human DevelopmentHORIZON EUROPE Marie Sklodowska-Curie ActionsNational Institute of Environmental Health SciencesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthOrionin TutkimussäätiöNorges ForskningsrådAcademy of FinlandZonMwEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentEuropean CommissionUK Research and InnovationNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome Trust
Mots-clésBiologyEpigenomeDNA methylationCord bloodMeta-analysisGeneticsBioinformaticsComputational biologyPhysiologyInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Low maternal vitamin D concentrations during pregnancy have been associated with a range of offspring health outcomes. DNA methylation is one mechanism by which the maternal vitamin D status during pregnancy could impact offspring’s health in later life. We aimed to evaluate whether maternal vitamin D insufficiency during pregnancy was conditionally associated with DNA methylation in the offspring cord blood. Maternal vitamin D insufficiency (plasma 25-hydroxy vitamin D ≤ 75 nmol/L) during pregnancy and offspring cord blood DNA methylation, assessed using Illumina Infinium 450k or Illumina EPIC Beadchip, was collected for 3738 mother–child pairs in 7 cohorts as part of the Pregnancy and Childhood Epigenetics (PACE) consortium. Associations between maternal vitamin D and offspring DNA methylation, adjusted for fetal sex, maternal smoking, maternal age, maternal pre-pregnancy or early pregnancy BMI, maternal education, gestational age at measurement of 25(OH)D, parity, and cell type composition, were estimated using robust linear regression in each cohort, and a fixed-effects meta-analysis was conducted. The prevalence of vitamin D insufficiency ranged from 44.3% to 78.5% across cohorts. Across 364,678 CpG sites, none were associated with maternal vitamin D insufficiency at an epigenome-wide significant level after correcting for multiple testing using Bonferroni correction or a less conservative Benjamini–Hochberg False Discovery Rate approach (FDR, p > 0.05). In this epigenome-wide association study, we did not find convincing evidence of a conditional association of vitamin D insufficiency with offspring DNA methylation at any measured CpG site.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,506
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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