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Enregistrement W4403519928 · doi:10.1158/2326-6074.tumimm24-a038

Abstract A038: Antigen Presentation By Cancer-Associated Fibroblasts

2024· article· en· W4403519928 sur OpenAlexaff
Eralda Kina, Caroline Côté, Jean‐David Larouche, Chantal Durette, Joël Lanoix, Éric Bonneil, Jean‐Philippe Laverdure, Gabriel Ouellet Lavallée, Margaret Buchanan, Adriana Aguilar, Fatima Mechta-Grigoriou, Pierre Thibault, Mark Basik, Claude Perreault

Notice bibliographique

RevueCancer Immunology Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging and Pathology Studies
Établissements canadiensJewish General HospitalUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCancerAntigenCancer immunotherapyPresentation (obstetrics)Antigen presentationImmunologyImmunotherapyCancer researchImmune systemInternal medicineT cellSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Immunotherapy has shown promise in treating some patients with metastatic diseases, but the effectiveness of the immune system in controlling cancer is hampered by a suppressive tumor microenvironment (TME), in which cancer-associated fibroblasts (CAFs) play a key role. Developing new and highly specific immunotherapeutic tools targeting CAFs may have a significative impact on tumor control. For this purpose, we aim to investigate antigen presentation characteristics by MHC-I molecules in CAFs and identify targetable CAF-specific antigens. Methods and Results: Analysis of existing single-cell datasets revealed higher expression of MHC-I in CAFs compared to normal fibroblasts (p<0.05) in various tumor types. In melanoma, higher MHC-I expression was linked to resistance to immune checkpoint blockade (ICB). Additionally, we found a positive correlation between MHC-I expression and immunosuppressive molecules such as galectin-9 and HVEM. These observations were supported by initial flow cytometry analyses in CAF cell lines derived from patients. Furthermore, prolonged and severe hypoxia further elevated MHC-I protein levels in CAF cell lines. Using a proteogenomic approach with mass spectrometry, we identified over 10,000 antigens in five patient-derived CAF cell lines from primary breast cancer tumors and one normal fibroblast cell line. By integrating single-cell and bulk RNA sequencing data from various tumors and normal tissues, we identified more than 20 CAF-specific or fibroblast-specific antigens. Conclusion: CAFs exhibit high MHC-I expression, which is amplified under hypoxic conditions. We have identified CAF-specific antigens that require evaluation for their immunogenicity, indicating the potential of CAFs as targets for antigen-based therapies. Citation Format: Eralda Kina, Caroline Côté, Jean-David Larouche, Chantal Durette, Joel Lanoix, Eric Bonneil, Jean-Philippe Laverdure, Gabriel Ouellet Lavallée, Margaret Buchanan, Adriana , Fatima Mechta-Grigoriou, Pierre Thibault, Mark Basik, Claude Perreault. Antigen Presentation By Cancer-Associated Fibroblasts [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Tumor Immunology and Immunotherapy; 2024 Oct 18-21; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Immunol Res 2024;12(10 Suppl):Abstract nr A038.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,514
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,480
Écart entre enseignants0,369 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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