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Enregistrement W4403526311 · doi:10.1101/2024.10.17.24315679

Reduction of clonal hematopoiesis mutation burden in coronary patients treated with low-dose colchicine

2024· preprint· en· W4403526311 sur OpenAlexafffund
Jean‐Claude Tardif, Lambert Busque, Steve Geoffroy, Johanna Sandoval, Louis‐Philippe Lemieux Perreault, Ian Mongrain, Diane Valois, Marie-Josée Gaulin-Marion, Manuel Buscarlet, Sylvie Provost, Aldo P. Maggioni, Simon Kouz, Fausto J. Pinto, José López-Sendón, David D. Waters, Rafael Díaz, Habib Gamra, Ghassan S. Kiwan, Colin Berry, Wolfgang Köenig, Jean‐Claude Grégoire, Philippe L. L’Allier, Mylène Provencher, Marie‐Claude Guertin, François Roubille, Essaïd Oussaïd, Amina Barhdadi, Marie‐Pierre Dubé

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMyeloproliferative Neoplasms: Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-RosemontUniversité de MontréalCegep regional de LanaudiereHealth Care FoundationMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchInstitut de Cardiologie de MontréalFondation Institut de Cardiologie de MontréalAstraZenecaCanada Research ChairsSanofiSingulex
Mots-clésColchicineReduction (mathematics)HaematopoiesisMutationMedicineInternal medicineGeneticsBiologyStem cellMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Clonal hematopoiesis involves mutations in hematopoietic stem/progenitor cells, which increase the risk of cardiovascular disease, particularly under pro-inflammatory conditions. This study assessed the impact of the anti-inflammatory medication colchicine on clonal hematopoiesis in patients with recent myocardial infarction from the COLCOT trial. Participants were randomly assigned to low-dose colchicine (0.5 mg daily) or placebo, with 848 providing two DNA samples for longitudinal analysis. Targeted error-corrected sequencing was used, and 15,919 mutations were followed over a median period of 19.5 months. The results showed significantly lower variant allele fractions in the colchicine group compared to placebo (p interaction=0.03), with notable reductions in TET2 (10.3%, p=0.007; p interaction=0.001), TP53 (11.8%, p=0.001; p interaction=0.03), and SF3B1 mutations (19.9%, p=0.006; p interaction=0.005). Thus, colchicine reduced the proportion of clonal hematopoiesis mutations in patients with coronary disease, and longer-term studies with diverse populations are needed to confirm its potential benefits in mitigating related health risks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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