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Enregistrement W4403538213 · doi:10.1111/mec.17560

Admixture With Cultivated Sunflower Likely Facilitated Establishment and Spread of Wild Sunflower (<i>Helianthus annuus</i>) in Argentina

2024· article· en· W4403538213 sur OpenAlexaff
Fernando Braz Tangerino Hernández, Román B. Vercellino, Marco Todesco, Natalia Bercovich, D. Alvarez, Johanne Brunet, Alejandro Presotto, Loren H. Rieseberg

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHelianthus annuusSunflowerHelianthusLocal adaptationRange (aeronautics)CropInvasive speciesPopulationBotanyAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A better understanding of the genetic and ecological factors underlying successful invasions is critical to mitigate the negative impacts of invasive species. Here, we study the invasion history of Helianthus annuus populations from Argentina, with particular emphasis on the role of post-introduction admixture with cultivated sunflower (also H. annuus) and climate adaptation driven by large haploblocks. We conducted genotyping-by-sequencing of samples of wild populations as well as Argentinian cultivars and compared them with wild (including related annual Helianthus species) and cultivated samples from the native range. We also characterised samples for 11 known haploblocks associated with environmental variation in native populations to test whether haploblocks contributed to invasion success. Population genomics analyses supported two independent geographic sources for Argentinian populations, the central United States and Texas, but no significant contribution of related annual Helianthus species. We found pervasive admixture with cultivated sunflower, likely as result of post-introduction hybridization. Genomic scans between invasive populations and their native sources identified multiple genomic regions of divergence, possibly indicative of selection, in the invaded range. These regions significantly overlapped between the two native-invasive comparisons and showed disproportionally high crop ancestry, suggesting that crop alleles contributed to invasion success. We did not find evidence of climate adaptation mediated by haploblocks, yet outliers of genome scans were enriched in haploblock regions and, for at least two haploblocks, the cultivar haplotype was favoured in Argentina. Our results show that admixture with cultivated sunflower played a major role in the establishment and spread of H. annuus populations in Argentina.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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