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Enregistrement W4403545889 · doi:10.1139/facets-2024-0015

Marine ecozones represent a major gap in Canadian DNA barcoding efforts

2024· article· en· W4403545889 sur OpenAlexaffvenueabout
Jessica A. Schultz, Paul D. N. Hebert

Notice bibliographique

RevueFACETS · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA barcodingGeographyOceanographyBiologyEvolutionary biologyGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Because of Canada’s large size, it is impractical to obtain a comprehensive perspective on biotic change through morphological approaches. DNA metabarcoding offers a potential path, but its application requires access to a well-parameterized DNA barcode reference library. This study presents the current state of DNA barcode coverage for Canadian animals, highlighting progress, identifying gaps, and providing recommendations for future research. Our analysis indicates that many of the known species (100 000 terrestrial and 6000 marine) in the Canadian fauna possess DNA barcode coverage, but there are important gaps geographically and taxonomically. We summarize DNA barcode coverage for the species in freshwater, marine, and terrestrial environments by ecoregion, finding that 95.6% of the 2.3 million Canadian barcode records derive from terrestrial ecosystems. Although the density of barcode records per 100 km² is 13x higher for terrestrial than aquatic environments (22.4 vs. 1.7), coverage for 58% of marine species is available (54% for annelids, 52% for arthropods, 88% for chordates, 39% for echinoderms, and 46% for molluscs). By revealing data-deficient areas and taxonomic groups, this study offers a roadmap for expanding the DNA barcode library for the Canadian fauna as an essential foundation for the scalable biosurveillance initiatives that inform biodiversity conservation efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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