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Enregistrement W4403553297 · doi:10.1101/2024.10.16.618703

Identification and characterization of a wet adhesive protein extracted from <i>Dreissena bugensis</i> , the freshwater quagga mussel

2024· preprint· en· W4403553297 sur OpenAlexaff
Angelico Obille, Judith Ng, Karina M. M. Carneiro, Eli D. Sone

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMarine Biology and Environmental Chemistry
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDreissenaMusselIdentification (biology)Freshwater bivalveFisheryAquatic animalBiologyEcologyZoologyMolluscaBivalviaFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mechanisms of wet adhesion have been developed by several aquatic organisms over millions of years of evolutionary processes. Yet, the repertoire of synthetic biocompatible wet adhesive materials is still limited. In most marine bioadhesive proteins, 3,4-dihydroxyphenylalanine (DOPA) plays a significant role in strong interfacial interactions. The bioadhesive proteins in freshwater organisms are less well understood. The quagga mussel ( Dreissena bugensis ) is a notorious freshwater invasive species in the Great Lakes that attaches to a plethora of surfaces via a byssus. To determine the adhesive proteins in the quagga mussel byssus, we utilized quantitative proteomics to identify the proteins enriched at the byssus-substrate interface. Among the identified proteins was the Dbfp7 protein family. Dbfp7 is a small, polymorphic, and mostly disordered protein that lacks significant amounts of DOPA. Atomic force microscopy measurements of Dbfp7 confirm that this protein has similar adhesion energy to marine mussel adhesive proteins in aqueous conditions despite lacking DOPA. These results suggest that freshwater mussels may employ different mechanisms of adhesion compared to marine byssates. The inclusion of Dbfp7 to the library of known wet bioadhesive proteins – the first functionally characterized freshwater bioadhesive protein to our knowledge – will allow for a better understanding of the fundamental properties required to achieve biocompatible wet adhesion, a crucial step for the development of bio-inspired wet adhesive materials, such as improved medical adhesives. Significance Statement While many aquatic organisms evolved strategies to adhere to surfaces underwater, current synthetic biocompatible adhesives lack reliable adhesive strength in varying aqueous conditions. Investigating freshwater mussel adhesive proteins expands the current understanding of aquatic bioadhesion and offers potential advancements in wet adhesive technology. The discovery of a DOPA-deficient wet adhesive protein derived from the invasive quagga mussels presents a paradigm shift to the currently known mechanisms of byssal bioadhesion, thereby expanding the repertoire of wet adhesive strategies. Further, understanding the mechanism of adhesion employed by this biofouling species can help with the design of anti-fouling strategies to mitigate the impacts of these animals on the infrastructure and ecosystems in the Great Lakes and connected freshwater systems in North America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,168
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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