MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4403558071 · doi:10.1016/j.ebiom.2024.105410

Transmission of highly virulent CXCR4 tropic HIV-1 through the mucosal route in an individual with a wild-type CCR5 genotype

2024· article· en· W4403558071 sur OpenAlexaff
Manukumar Honnayakanahalli Marichannegowda, Saini Setua, Meera Bose, Eric Sanders‐Buell, David B. King, Michelle Zemil, Lindsay Wieczorek, Felisa Diaz‐Mendez, Nicolas Chomont, Rasmi Thomas, Leilani Francisco, Leigh Anne Eller, Victoria R. Polonis, Sodsai Tovanabutra, Alonso Heredia, Yutaka Tagaya, Nelson L. Michael, Merlin L. Robb, Hongshuo Song

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthHenry M. Jackson FoundationU.S. Department of Defense
Mots-clésVirulenceGenotypeVirologyBiologyTransmission (telecommunications)Human immunodeficiency virus (HIV)LentivirusCXCR4GeneticsGeneViral diseaseReceptorChemokineComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Nearly all transmitted/founder (T/F) HIV-1 are CCR5 (R5)-tropic. While previous evidence suggested that CXCR4 (X4)-tropic HIV-1 are transmissible, virus detection and characterization were not at the earliest stages of acute infection. METHODS: T cells using pseudovirus and infectious molecular clones. CD4 subset dynamics were analyzed using flow cytometry. Viral load in each CD4 subset was quantified using cell-associated HIV RNA assay and total and integrated HIV DNA assay. FINDINGS: T cell activation was observed over time. This X4-tropic T/F virus is resistant to broadly neutralizing antibodies (bNAbs) targeting V1/V2 and V3 regions, while most of the R5 T/F viruses in the same cohort are sensitive to the same panel of bNAbs. INTERPRETATION: X4-tropic HIV-1 is transmissible through mucosal route in people with wild-type CCR5 genotype. The CD4 subset tropism of HIV-1 may be an important determinant for HIV-1 transmissibility and virulence. FUNDING: Institute of Human Virology, National Institutes of Health, Henry M. Jackson Foundation for the Advancement of Military Medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,765
Score d'incertitude au seuil0,508

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEBioMedicineMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207