MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4403597476 · doi:10.2196/58720

Toward a Clinical Decision Support System for Monitoring Therapeutic Antituberculosis Medical Drugs in Tanzania (Project TuberXpert): Protocol for an Algorithm' Development and Implementation

2024· article· en· W4403597476 sur OpenAlexvenueno aff
Yann Thoma, Annie E. Cathignol, Yuan Pétermann, Margaretha Sariko, Bibie Said, Chantal Csajka, Monia Guidi, Stellah Mpagama

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésMedicineClinical decision support systemProtocol (science)PopulationTherapeutic drug monitoringNONMEMTanzaniaRifampicinIntensive care medicineTuberculosisDecision support systemDrugDosingPharmacologyAlternative medicineComputer scienceData miningPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The end tuberculosis (TB) strategy requires a novel patient treatment approach contrary to the one-size-fits-all model. It is well known that each patient's physiology is different and leads to various rates of drug elimination. Therapeutic drug monitoring (TDM) offers a way to manage drug dosage adaptation but requires trained pharmacologists, which is scarce in resource-limited settings. OBJECTIVE: We will develop an automated clinical decision support system (CDSS) to help practitioners with the dosage adaptation of rifampicin, one of the essential medical drugs targeting TB, that is known for large pharmacokinetic variability and frequent suboptimal blood exposure. Such an advanced system will encourage the spread of a dosage-individualization culture, including among practitioners not specialized in pharmacology. Thus, the objectives of this project are to (1) develop the appropriate population pharmacokinetic (popPK) model for rifampicin for Tanzanian patients, (2) optimize the reporting of relevant information to practitioners for drug dosage adjustment, (3) automate the delivery of the report in line with the measurement of drug concentration, and (4) validate and implement the final system in the field. METHODS: A total of 3 teams will combine their efforts to deliver the first automated TDM CDSS for TB. A cross-sectional study will be conducted to define the best way to display information to clinicians. In parallel, a rifampicin popPK model will be developed taking advantage of the published literature, complemented with data provided by existing literature data from the Pan-African Consortium for the Evaluation of Antituberculosis Antibiotics (panACEA), and samples collected within this project. A decision tree will be designed and implemented as a CDSS, and an automated report generation will be developed and validated through selected case studies. Expert pharmacologists will validate the CDSS, and finally, field implementation in Tanzania will occur, coupled with a prospective study to assess clinicians' adherence to the CDSS recommendations. RESULTS: The TuberXpert project started in November 2022. In July 2024, the clinical study in Tanzania was completed with the enrollment of 50 patients to gather the required data to build a popPK model for rifampicin, together with a qualitative study defining the report design, as well as the CDSS general architecture definition. CONCLUSIONS: At the end of the TuberXpert project, Tanzania will possess a new tool to help the practitioners with the adaptation of drug dosage targeting complicated TB cases (TB or HIV, TB or diabetes mellitus, and TB or malnutrition). This automated system will be validated and used in the field and will be proposed to other countries affected by endemic TB. In addition, this approach will serve as proof of concept regarding the feasibility and suitability of CDSS-assisted TDM for further anti-TB drugs in TB-burdened areas deprived of TDM experts, including second-line treatments considered important to monitor. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/58720.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,050
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,265

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0500,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0340,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,372
Tête enseignante GPT0,643
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJMIR Research Protocols→Même sujetTuberculosis Research and Epidemiology→Travaux en français237 207→