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Enregistrement W4403640748 · doi:10.1103/prxlife.2.043005

Mitochondrial Network Branching Enables Rapid Protein Spread with Slower Mitochondrial Dynamics

2024· article· en· W4403640748 sur OpenAlexafffund
Prabha Chuphal, Jordan D. Lanctôt, Sean P. Cornelius, Aidan I. Brown

Notice bibliographique

RevuePRX Life · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlliance de recherche numérique du Canada
Mots-clésBranching (polymer chemistry)BiophysicsBiologyBiological systemChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial network structure is controlled by the dynamical processes of fusion and fission, which merge and split mitochondrial tubes into structures including branches and loops. To investigate the impact of mitochondrial network dynamics and structure on the spread of proteins and other molecules through mitochondrial networks, we used stochastic simulations of two distinct quantitative models that each included mitochondrial fusion and fission, and particle diffusion via the network. Better-connected mitochondrial networks and networks with faster dynamics exhibit more rapid particle spread on the network, with little further improvement once a network has become well connected. As fragmented networks gradually become better connected, particle spread either steadily improves until the networks become well connected for slow-diffusing particles or plateaus for fast-diffusing particles. We compared model mitochondrial networks with both end-to-end and end-to-side fusion, which form branches, to nonbranching model networks that lack end-to-side fusion. To achieve the optimum (most rapid) spread that occurs on well-connected branching networks, nonbranching networks require much faster fusion and fission dynamics. Thus, the process of end-to-side fusion, which creates branches in mitochondrial networks, enables rapid spread of particles on the network with relatively slow fusion and fission dynamics. This modeling of protein spread on mitochondrial networks builds toward mechanistic understanding of how mitochondrial structure and dynamics regulate mitochondrial function. Published by the American Physical Society 2024

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,796
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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