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Enregistrement W4403646763 · doi:10.1016/j.celrep.2024.114899

ADA2 is a lysosomal deoxyadenosine deaminase acting on DNA involved in regulating TLR9-mediated immune sensing of DNA

2024· article· en· W4403646763 sur OpenAlexfundno aff
Ole Kristian Greiner-Tollersrud, Máté Krausz, Vincent Boehler, Aikaterini Polyzou, Maximilian Seidl, Ambra Spahiu, Zeinab Abdullah, Katarzyna Andryka-Cegielski, Felix Immunuel Dominick, Katrin Huebscher, Andreas Goschin, Cristian R. Smulski, Eirini Trompouki, Regina Link, Hilmar Ebersbach, Honnappa Srinivas, Martine Marchant, Georgios Sogkas, Dieter Staab, Cathrine Broberg Vågbø, Danilo Guerini, Sebastian Baasch, Eicke Latz, Gunther Hartmann, Philipp Henneke, Roger Geiger, Xiao Peng, Bodo Grimbacher, Eva Bartok, Ingrun Alseth, Max Warncke, Michele Proietti

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFritz Thyssen StiftungAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgDeutsche ForschungsgemeinschaftADA FoundationCross Cancer Institute
Mots-clésDeoxyadenosineDNAImmune systemTLR9Cell biologyAdenosine deaminaseBiologyChemistryBiochemistryGeneticsGeneEnzymeDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although adenosine deaminase 2 (ADA2) is considered an extracellular ADA, evidence questions the physiological relevance of this activity. Our study reveals that ADA2 localizes within the lysosomes, where it is targeted through modifications of its glycan structures. We show that ADA2 interacts with DNA molecules, altering their sequences by converting deoxyadenosine (dA) to deoxyinosine (dI). We characterize its DNA substrate preferences and provide data suggesting that DNA, rather than free adenosine, is its natural substrate. Finally, we demonstrate that dA-to-dI editing of DNA molecules and ADA2 regulate lysosomal immune sensing of nucleic acids (NAs) by modulating Toll-like receptor 9 (TLR9) activation. Our results describe a mechanism involved in the complex interplay between NA metabolism and immune response, possibly impacting ADA2 deficiency (DADA2) and other diseases involving this pathway, including autoimmune diseases, cancer, or infectious diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,933

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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