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Enregistrement W4403650421 · doi:10.1017/jme.2024.114

A Proposed Research Agenda for Ethical, Legal, Social, and Historical Studies at the Intersection of Infectious and Genetic Disease

2024· review· en· W4403650421 sur OpenAlexaff
François Cholette, Paul J. McLaren

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Law Medicine & Ethics · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInfectious disease (medical specialty)DiseaseGenomicsGenome-wide association studyPandemicPublic healthTuberculosisBiologyGenomeGeneticsMedicineSingle-nucleotide polymorphismCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the past two decades there has been a rapid expansion in our understanding of how human genetic variability impacts susceptibility and severity of disease. Through applications of genome-wide association studies, genome and exome sequencing, researchers have made thousands of discoveries of genetic variants that impact risk of common and rare disorders affecting millions of people. Although these techniques have been primarily applied to highly prevalent chronic disorders such as diabetes1 and cardiovascular disease2, infectious diseases have proven to not be immune to genome-wide association, with studies of Tuberculosis3, HIV4 and SARS-CoV25, to name but a few, identifying host susceptibility loci across the genome. Unlike non-communicable diseases, infectious diseases have the unique element of impacting not only the affected the host, but those who may be most vulnerable to acquiring the infection. Thus, genetic variants that impact one individual’s susceptibility to and severity of an infection may also have broader implications to public health, as was brought into keen focus during the COVID-19 pandemic. Therefore, as we begin to apply the knowledge gained from genomic studies in the clinic or into policy, there are unique ethical, legal, and social implications (ELSI) at the intersection of infectious diseases and human genomics. In this issue of the Journal of Law, Medicine and Ethics, Jose et al attempt to address this need by proposing a research agenda for ELSI studies at what they term the “blurred boundaries” of infectious and genetic diseases.6

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,156
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,103
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil0,826

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1560,103
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0240,083
Communication savante0,0370,051
Science ouverte0,0090,026
Intégrité de la recherche0,0770,069
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,353
Tête enseignante GPT0,530
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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