<i>Pseudomonas aeruginosa</i> supports the survival of <i>Prevotella melaninogenica</i> in a cystic fibrosis lung polymicrobial community through metabolic cross-feeding
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cystic fibrosis (CF) is a multi-organ genetic disorder that affects more than 100,000 individuals worldwide. Chronic respiratory infections are among the hallmark complications associated with CF lung disease, and these infections are often due to polymicrobial communities that colonize the airways of persons with CF (pwCF). Such infections are a significant cause of morbidity and mortality, with studies indicating that pwCF who are co-infected with more than one organism experience more frequent pulmonary exacerbations, leading to a faster decline in lung function. Previous work established an in vitro CF-relevant polymicrobial community model composed of P. aeruginosa , S. aureus , S. sanguinis , and P. melaninogenica . P. melaninogenica cannot survive in monoculture in this model. In this study, we leverage this model to investigate the interactions between P. aeruginosa and P. melaninogenica , allowing us to understand the mechanisms by which the two microbes interact to support the growth of P. melaninogenica specifically in the context of the polymicrobial community. We demonstrate a cross-feeding mechanism whereby P. melaninogenica metabolizes mucin into short-chain fatty acids that are in turn utilized by P. aeruginosa and converted into metabolites (succinate, acetate) that are cross-fed to P. melaninogenica , supporting the survival of this anaerobe in the CF lung-relevant model. Importance Polymicrobial interactions impact disease outcomes in pwCF who suffer from chronic respiratory infections. Previous work established a CF-relevant polymicrobial community model that allows experimental probing of these microbial interactions to achieve a better understanding of the factors that govern the mechanisms by which CF lung microbes influence each other. In this study, we investigate the interaction between P. aeruginosa and P. melaninogenica , which are two highly prevalent and abundant CF lung microbes. We uncover a cross-feeding mechanism that requires the metabolism of mucin by P. melaninogenica to generate short-chain fatty acids that are cross-fed to P. aeruginosa , and into metabolized into metabolites which are then cross-fed back to P. melaninogenica to support the growth of this anaerobe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».