Seasonal stability of the rumen microbiome contributes to the adaptation patterns to extreme environmental conditions in grazing yak and cattle
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The rumen microbiome plays an essential role in maintaining ruminants' growth and performance even under extreme environmental conditions, however, which factors influence rumen microbiome stability when ruminants are reared in such habitats throughout the year is unclear. Hence, the rumen microbiome of yak (less domesticated) and cattle (domesticated) reared on the Qinghai-Tibetan Plateau through the year were assessed to evaluate temporal changes in their composition, function, and stability. RESULTS: Rumen fermentation characteristics and pH significantly shifted across seasons in both cattle and yak, but the patterns differed between the two ruminant species. Ruminal enzyme activity varied with season, and production of xylanase and cellulase was greater in yak compared to cattle in both fall and winter. The rumen bacterial community varied with season in both yak and cattle, with higher alpha diversity and similarity (beta diversity) in yak than cattle. The diversity indices of eukaryotic community did not change with season in both ruminant species, but higher similarity was observed in yak. In addition, the similarity of rumen microbiome functional community was higher in yak than cattle across seasons. Moreover, yak rumen microbiome encoded more genes (GH2 and GH3) related to cellulose and hemicellulose degradation compared to cattle, and a new enzyme family (GH160) gene involved in oligosaccharides was uniquely detected in yak rumen. The season affected microbiome attenuation and buffering values (stability), with higher buffering value in yak rumen microbiome than cattle. Positive correlations between antimicrobial resistance gene (dfrF) and CAZyme family (GH113) and microbiome stability were identified in yak, but such relationship was negatively correlated in cattle. CONCLUSIONS: The findings of the potential of cellulose degradation, the relationship between rumen microbial stability and the abundance of functional genes varied differently across seasons and between yak and cattle provide insight into the mechanisms that may underpin their divergent adaptation patterns to the harsh climate of the Qinghai-Tibetan Plateau. These results lay a solid foundation for developing strategies to maintain and improve rumen microbiome stability and dig out the potential candidates for manufacturing lignocellulolytic enzymes in the yak rumen to enhance ruminants' performance under extreme environmental conditions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».