Modeling the ionization mechanism of amorphous solid particles without an external energy source coupled to mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
desorption of charged analytes from the surface of solid amorphous glutaric acid particles, without the assistance of an external energy source, has been shown to be a promising method that can be coupled to mass spectrometry. We conduct mechanistic studies of the later stages of this ionization process using atomistic molecular dynamics. Our analysis focuses on the hydrogen bonding, diffusion, and ion desorption from nano-aggregates of glutaric acid. These nano-aggregates exhibit an extended H-bonded network, often comprising H-bonded chains, linear dimeric assemblies, and occasionally cyclic trimeric assemblies. These local structures serve as centers for proton transfer reactions. The intermediate hydrocarbon chain between the proton-carrying oxygen sites prevents proton diffusion over a long distance unless there is significant translational or rotational movement of the proton-carrying diacid molecule. Our calculations show that diffusion on the surface is an order of magnitude faster than in the core of the nano-aggregate, which aids effective proton transfer on the particle's exterior. We find that ionic species desorb from the aggregate's surface through independent evaporation events of small clusters, where the ion is coordinated by only a few glutaric acid molecules. Near the nano-aggregate's Rayleigh limit, jets capable of releasing multiple ions were not observed. These observations suggest a more general ion-evaporation mechanism that applies to low-dielectric particles of various sizes, complementing the original ion-evaporation mechanism proposed for aqueous droplets with an approximate radius of 10-15 nm. The combined evidence from molecular modeling presented here and the thermodynamic properties of solid and supercooled liquid glutaric acid indicates that the stronger signals of glutaric acid observed in the mass spectra, relative to other experimentally tested diacids, can be attributed to its significantly lower melting point and the reduced enthalpy of vaporization of its amorphous state compared to other tested diacids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».