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Enregistrement W4403714283 · doi:10.1007/s00428-024-03886-6

Exploratory evidence maps for the WHO Classification of Tumours 5th edition for lung and thymus tumors

2024· article· en· W4403714283 sur OpenAlexaff
Christine Giesen, Javier Del-Águila-Mejía, Subasri Armon, Ramon Cierco Jiménez, Nickolas Myles, Gabrielle Goldman‐Lévy, Alberto Machado, Iciar Indave, Ian A. Cree, Dilani Lokuhetty

Notice bibliographique

RevueArchiv für Pathologische Anatomie und Physiologie und für Klinische Medicin · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensProvidence Health Care
Organismes subventionnairesHorizon 2020European CommissionWorld Health Organization
Mots-clésPathologyLungMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The WHO Classification of Tumours (WCT) guides cancer diagnosis, treatment, and research. However, research evidence in pathology continuously changes, and new evidence emerges. Correct assessment of evidence in the WCT 5th edition (WCT-5) and identification of high level of evidence (LOE) studies based on study design are needed to improve future editions. We aimed at producing exploratory evidence maps for WCT-5 Thoracic Tumours, specifically lung and thymus tumors. We extracted citations from WCT-5, and imported and coded them in EPPI-Reviewer. The maps were plotted using EPPI-Mapper. Maps displayed tumor types (columns), descriptors (rows), and LOE (bubbles using a four-color code). We included 1434 studies addressing 51 lung, and 677 studies addressing 25 thymus tumor types from WCT-5 thoracic tumours volume. Overall, 87.7% (n = 1257) and 80.8% (n = 547) references were low, and 4.1% (n = 59) and 2.2% (n = 15) high LOE for lung and thymus tumors, respectively. Invasive non-mucinous adenocarcinoma of the lung (n = 215; 15.0%) and squamous cell carcinoma of the thymus (n = 93; 13.7%) presented the highest number of references. High LOE was observed for colloid adenocarcinoma of the lung (n = 11; 18.2%) and type AB thymoma (n = 4; 1.4%). Tumor descriptors with the highest number of citations were prognosis and prediction (n = 273; 19.0%) for lung, and epidemiology (n = 186; 28.0%) for thymus tumors. LOE was generally low for lung and thymus tumors. This study represents an initial step in the WCT Evidence Gap Map (WCT-EVI-MAP) project for mapping references in WCT-5 for all tumor types to inform future WCT editions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,174
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,106

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,174
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,010
Bibliométrie0,0870,060
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0020,007
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0300,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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