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Enregistrement W4403726526 · doi:10.14309/01.ajg.0001032728.25473.79

S840 Evaluation of Machine Learning Models for the Assessment of the Endoscopic Mayo Score in Ulcerative Colitis: A Systematic Review

2024· review· en· W4403726526 sur OpenAlexaff
David T. Rubin, Walter Reinisch, Neeraj Narula, Daniel Colucci, William Eastman, Klaus Gottlieb, Ana P. Lacerda, Stephen Laroux, Irene Modesto, Emma Navajas, Charles Owen, Yeli Wang, Shrujal S. Baxi

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Screening and Detection
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineUlcerative colitisInternal medicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The endoscopic Mayo Score (eMS) is intended to provide an objective measurement of endoscopy and is a critical component of related endpoints in Ulcerative Colitis (UC) clinical trials. Wide variability in eMS grading has been reported among central readers, contributing to inconsistency in endoscopic results. Machine learning (ML) models offer a standardized solution. Adoption of an automated eMS model requires testing to demonstrate model performance and generalizability. The objective of this study is to provide a systematic review on testing of ML eMS prediction models on full-length endoscopic video recordings from patients with UC. Methods: Studies evaluating video-level eMS prediction models on UC endoscopy video datasets (independent of data used in model training) were included. We included all full-length manuscripts from human studies published in English. PubMed/MEDLINE, EMBASE, and Web of Science were systematically searched on December 31, 2023, and supplemented by reference checks and Google search. Three rounds of title screening were conducted. Information on test set characteristics and performance on clinically relevant endpoints were extracted independently by 2 authors, with disparities resolved through discussion. Results: Five studies met criteria for inclusion, reporting data from 6 unique test cohorts. Five cohorts were internal test cohorts with 2 involving trial data (n=134-147 videos) and 3 involving data from routine care (n=27-51 videos). One cohort was an external test cohort which involved trial data (n=264 videos). Definition of the reference standard (i.e. ground truth) varied across studies with 2 cohorts reporting adjusted analyses based on modification to the definition of the reference standard. Accuracy in predicting ordinal eMS grades (0, 1, 2, 3) ranged from 56.8-83.3%. Accuracy in predicting eMS 0, 1 vs 2, 3 and eMS 0 vs 1, 2, 3 (each aligned with a definition of endoscopic improvement and remission in trials) ranged from 84-90.2% and 90-95.5%, respectively. Conclusion: Several studies have reported promising data on the performance of ML models to determine video-level eMS grades as determined by human readers in UC. This technology may ultimately provide less biased endoscopic assessments and improve standardization across clinical trials in UC. Further validation and consistency of test dataset characteristics are required to ensure model generalizability and to enable comparison across models (Figure 1).Figure 1.: Description of test dataset characteristics and model performance against key endpoints. Key endpoints include ordinal eMS, eMS 0, 1 vs 2, 3 (a definition of endoscopic improvement in trials), and eMS 0 vs 1,2,3 (a definition of endoscopic remission in trials). All test sets are independent of those used in model training. Red indicates testing on a clinical trial dataset. Blue indicates testing on a routine care dataset. * indicates testing on an external test set (relative to an internal test set from the same site or a holdout of the model training dataset). ^ indicates cohort results in an adjusted analysis based on modification to the definition of the reference standard. Acc, accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,074
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,112

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,074
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,012
Bibliométrie0,0120,009
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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