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Enregistrement W4403731707 · doi:10.1038/s41431-024-01701-z

BCL11A intellectual developmental disorder: defining the clinical spectrum and genotype-phenotype correlations

2024· article· en· W4403731707 sur OpenAlexaff
Angela Peron, Felice D’Arco, Kimberly A. Aldinger, Constance Smith‐Hicks, Christiane Zweier, Gyri Aasland Gradek, Kimberley Bradbury, Andrea Accogli, Erica Andersen, Ping Yee Billie Au, Roberta Battini, Daniah Beleford, Lynne M. Bird, Arjan Bouman, Ange‐Line Bruel, Øyvind L. Busk, Philippe M. Campeau, Colleen M. Carlston, Jenny Carmichael, Anna Chassevent, Jill Clayton‐Smith, Michael J. Bamshad, Dawn Earl, Laurence Faivre, Christophe Philippe, Patrick Ferreira, Luitgard Graul‐Neumann, Mary J. Green, Darrah Haffner, Parthiv Haldipur, Suhair Hanna, Gunnar Houge, Wendy D. Jones, Cornelia Kraus, Birgit Elisabeth Kristiansen, James Lespinasse, Karen Low, Sally Ann Lynch, Sofia Maia, Rong Mao, Ruta Kalinauskiene, Catherine Melver, Kimberly S. McDonald, Tara Montgomery, Manuela Morleo, Constance Motter, Amanda Openshaw, Janice C. Palumbos, Aditi Shah Parikh, Yezmin Perilla‐Young, Cynthia M. Powell, Richard Person, Megha Desai, Juliette Piard, Rolph Pfundt, Marcello Scala, Margaux Serey‐Gaut, Deborah Shears, Anne Slavotinek, Mohnish Suri, Claire Turner, Tatiana Tvrdik, Karin Weiss, Ingrid M. Wentzensen, Marcella Zollino, Tzung‐Chien Hsieh, Keri Ramsey, Bert B.A. de Vries, François Guillemot, William B. Dobyns, David Viskochil, Cristina Dias

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Human Genetics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineAlberta Children's HospitalUniversité de MontréalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Cancer InstituteNational Center for Advancing Translational SciencesWellcome TrustNational Human Genome Research InstituteNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteCenter for Mendelian Genomics, University of WashingtonFrancis Crick InstituteSeattle Children's Research InstituteUniversity of WashingtonNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésMicrocephalyHypotoniaIntellectual disabilityFrameshift mutationCohortGeneticsAutism spectrum disorderBiologyNeurodevelopmental disorderPhenotypeMedicineAutismInternal medicineGenePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An increasing number of individuals with intellectual developmental disorder (IDD) and heterozygous variants in BCL11A are identified, yet our knowledge of manifestations and mutational spectrum is lacking. To address this, we performed detailed analysis of 42 individuals with BCL11A-related IDD (BCL11A-IDD, a.k.a. Dias-Logan syndrome) ascertained through an international collaborative network, and reviewed 35 additional previously reported patients. Analysis of 77 affected individuals identified 60 unique disease-causing variants (30 frameshift, 7 missense, 6 splice-site, 17 stop-gain) and 8 unique BCL11A microdeletions. We define the most prevalent features of BCL11A-IDD: IDD, postnatal-onset microcephaly, hypotonia, behavioral abnormalities, autism spectrum disorder, and persistence of fetal hemoglobin (HbF), and identify autonomic dysregulation as new feature. BCL11A-IDD is distinguished from 2p16 microdeletion syndrome, which has a higher incidence of congenital anomalies. Our results underscore BCL11A as an important transcription factor in human hindbrain development, identifying a previously underrecognized phenotype of a small brainstem with a reduced pons/medulla ratio. Genotype-phenotype correlation revealed an isoform-dependent trend in severity of truncating variants: those affecting all isoforms are associated with higher frequency of hypotonia, and those affecting the long (BCL11A-L) and extra-long (-XL) isoforms, sparing the short (-S), are associated with higher frequency of postnatal microcephaly. With the largest international cohort to date, this study highlights persistence of fetal hemoglobin as a consistent biomarker and hindbrain abnormalities as a common feature. It contributes significantly to our understanding of BCL11A-IDD through an extensive unbiased multi-center assessment, providing valuable insights for diagnosis, management and counselling, and into BCL11A's role in brain development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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