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Enregistrement W4403750014 · doi:10.3103/s0891416824700149

Lactoflora Species Diversity in the Vaginal Microbiome of Russian Women

2024· article· en· W4403750014 sur OpenAlexaff
Demkin Vv, Stanislav I. Koshechkin

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics Microbiology and Virology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensCytodiagnostics (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMicrobiomeDiversity (politics)Evolutionary biologyEcologyGeneticsAnthropologySociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The purpose of this study was to investigate the distribution and assess the quantitative prevalence of various species of lactobacilli in the vaginal biocenosis of women in the Russian Federation with various physiological and dysbiotic conditions of the pelvic organs. During the research, 840 vaginal smears obtained from four cities of the Russian Federation were tested for the presence of lactobacilli and their species specificity. Smears were taken both for medical reasons and from apparently healthy women undergoing preventive checkups. Determination of the total content of bacteria and lactobacilli was carried out using quantitative polymerase chain reaction (PCR) with SYBR Green. Multiplex quantitative PCR using species-specific probes was used to detect and differentiate a total of 12 species of lactobacilli, potentially capable of colonizing the vaginal biocenosis. The most common species were L. iners (51.2%) and L. crispatus (43%), while L. jensenii (18.3%) and L. gasseri (7.9%) were seen less commonly. Other types of lactobacilli were sporadic. In 75% of cases, only one species of lactobacilli was predominant, whereas in 25% two to four species were co-dominating. Given a high proportion of lactobacilli in the total bacterial mass (>70%), L. crispatus was more common, while L. iners predominated if this proportion was low (<30%). However, no relationship was found between the age or region of residence of patients and the prevalence of Lactobacillus species. Only four species of lactobacilli, namely, L. crispatus, L. iners, L. jensenii, and L. gasseri, prevailed in the vaginal biocenosis of 97% of study participants, including both healthy women and women with various disorders of genital tract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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