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Enregistrement W4403782459 · doi:10.1186/s12932-024-00094-8

Probing atomic-scale processes at the ferrihydrite-water interface with reactive molecular dynamics

2024· article· en· W4403782459 sur OpenAlexafffund
Ardalan Hayatifar, Simon Gravelle, Beatriz D. Moreno, Valerie A. Schoepfer, Matthew B.J. Lindsay

Notice bibliographique

RevueGeochemical Transactions · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueIron oxide chemistry and applications
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)University of Saskatchewan
Organismes subventionnairesHorizon 2020Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFerrihydriteMolecular dynamicsChemical physicsChemistryAdsorptionAqueous solutionSurface waterMetadynamicsPhysical chemistryComputational chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interfacial processes involving metal (oxyhydr)oxide phases are important for the mobility and bioavailability of nutrients and contaminants in soils, sediments, and water. Consequently, these processes influence ecosystem health and functioning, and have shaped the biological and environmental co-evolution of Earth over geologic time. Here we employ reactive molecular dynamics simulations, supported by synchrotron X-ray spectroscopy to study the molecular-scale interfacial processes that influence surface complexation in ferrihydrite-water systems containing aqueous $${\text {MoO}_4}^{2-}$$ MoO 4 2 - . We validate the utility of this approach by calculating surface complexation models directly from simulations. The reactive force-field captures the realistic dynamics of surface restructuring, surface charge equilibration, and the evolution of the interfacial water hydrogen bond network in response to adsorption and proton transfer. We find that upon hydration and adsorption, ferrihydrite restructures into a more disordered phase through surface charge equilibration, as revealed by simulations and high-resolution X-ray diffraction. We observed how this restructuring leads to a different interfacial hydrogen bond network compared to bulk water by monitoring water dynamics. Using umbrella sampling, we constructed the free energy landscape of aqueous $${\text {MoO}_4}^{2-}$$ MoO 4 2 - adsorption at various concentrations and the deprotonation of the ferrihydrite surface. The results demonstrate excellent agreement with the values reported by experimental surface complexation models. These findings are important as reactive molecular dynamics opens new avenues to study mineral-water interfaces, enriching and refining surface complexation models beyond their foundational assumptions. Graphic Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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