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Enregistrement W4403788619 · doi:10.1101/2024.10.24.620152

<i>Irx3/5</i> define the cochlear sensory domain and regulate vestibular and cochlear sensory patterning in the mammalian inner ear

2024· preprint· en· W4403788619 sur OpenAlexaff
Yuchen Liu, Tianli Qin, Xin Weng, Karl Kam Hei So, Boshi Wang, Wanying Feng, Alexander J Marsolais, Sheena A. Josselyn, Pingbo Huang, Bernd Fritzsch, Chi-chung Hui, MH Sham

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHearing, Cochlea, Tinnitus, Genetics
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVestibular systemInner earSensory systemNeuroscienceBiologyCochleaAnatomyAudiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The mammalian inner ear houses the vestibular and cochlear sensory organs dedicated to sensing balance and sound, respectively. These distinct sensory organs arise from a common prosensory region, but the mechanisms underlying their divergence remain elusive. Here, we showed that two evolutionarily conserved homeobox genes, Irx3 and Irx5 , are required for the patterning and segregation of the saccular and cochlear sensory domains, as well as for the formation of auditory sensory cells. Irx3/5 were highly expressed in the cochlea, their deletion resulted in a significantly shortened cochlea with a loss of the ductus reuniens that bridged the vestibule and cochlea. Remarkably, ectopic vestibular hair cells replaced the cochlear non-sensory structure, the Greater Epithelial Ridge. Moreover, most auditory sensory cells in the cochlea were transformed into hair cells of vestibular identity, with only a residual organ of Corti remaining in the mid-apical region of Irx3/5 double knockout mice. Conditional temporal knockouts further revealed that Irx3/5 are essential for controlling cochlear sensory domain formation before embryonic day 14. Our findings demonstrate that Irx3/5 regulate the patterning of vestibular and cochlear sensory cells, providing insights into the separation of vestibular and cochlear sensory organs during mammalian inner ear development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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