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Enregistrement W4403806843 · doi:10.1101/2024.10.23.619919

Circular RNA AEBP2: A novel regulator in dendritic cell development

2024· preprint· en· W4403806843 sur OpenAlexaff
Qinfeng Zhou, Bowen Wang, Shuailong Li, Adam Greasley, Wei‐Ping Min, Saman Maleki Vareki, Xiufen Zheng

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRegulatorCell biologyCircular RNARNABiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Dendritic cells (DCs) are the main antigen-presenting cells and play a central role in activating adaptive immunity. How DCs is regulated during their development remains to be further elucidated. Circular RNA (circRNA) is a new type of non-coding RNA playing a critical in various cell events. However, little is known about the role of circRNA in DCs. Using in situ RNA hybridization, we found that DCs expressed exonic circular RNA AEBP2 (circAEBP2). circAEBP2 was upregulated in mature DCs compared to immature DCs. Knockdown of circAEBP2 in DCs using small interference RNA (siRNA) arrested DCs at an immature state with lower expression of MHC class II, CD40, CD80, and CD83. circAEBP2 knockdown in DCs also decreased the phosphorylation of nuclear factor-kappa B p65 (P-p65) but increased CD200R1. CircAEBP2-silenced DCs had a lower capacity to activate allogeneic CD4 + and CD8 + T cells in vitro and induced differentiation of regulatory T cells (Tregs). RNA immunoprecipitation assays revealed that circAEBP2 interacts with heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F (hnRNP F) which is highly expressed in DCs and subsequently prevented hnRNP F nuclear translocation. In conclusion, we demonstrate that circAEBP2 regulates the development and function of DCs and knockdown of circAEBP2 induces tolerogenic DCs (Tol-DCs) through interacting with the hnRNP F/CD200R1/P-p65 signaling pathway. circAEBP2 is a new regulator in DCs and modulating it provides a novel strategy for inducing Tol-DCs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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