Associations of APOL1 Biallelic and Monoallelic Kidney Disease Variants with CKDs in West Africans: H3Africa KDRN Study
Notice bibliographique
Résumé
Background: Background: Apolipoprotein L1 gene (APOL1) variants are risk factors for chronic kidney disease (CKD) among African Americans (AA). Data are sparse on the genetic epidemiology and clinical association of APOL1 variants with CKD in West Africans, a major group among the AA population. Methods: The Human Health and Heredity in Africa (H3Africa) Kidney Disease Research Network studied 8,355 participants from Ghana and Nigeria: 4,712 participants with CKD stages 2-5, 866 participants with biopsy proven glomerular diseases, and 2777 controls (eGFR ≥90 ml/min/1.73m2 and no proteinuria). The association of CKD with high-risk carriers (two APOL1 alleles) and low-risk carriers (<2 APOL1 alleles) was determined by fitting logistic regression models controlling for covariates, including clinical site, age, and sex. Results: Monoallelic and biallelic APOL1 variant prevalence were 43.0% and 29.7%, respectively. Compared with low-risk carriers, the adjusted odds of CKD and focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) among high-risk carriers were 1.25 (95%CI: 1.11-1.40) and 1.84 (95%CI 1.30-2.61), respectively. Compared with those with no APOL1 variant (G0/G0), persons with one APOL1 variant (G0/G1, G0/G2) had higher odds of CKD (OR 1.18, 95% CI 1.04-1.33) and FSGS (adjusted OR 1.61; 95% CI 1.04-2.48). Covariates did not modify the association of 1-2 APOL1 variants with CKD or FSGS. Conclusion: Both monoallelic (G1/G0, G2/G0) and biallelic (G1/G1, G2/G2, G1/G2) risk variants have 18% and 25% higher odds of CKD, and 61% and 84% higher odds of FSGS, respectively. Individuals with monoallelic APOL1 variant should be classified as being at high risk for CKD and FSGS. Funding: NIDDK Support - NIDDK Support, NIDDK Support
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».