MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4403811363 · doi:10.1681/asn.2024a27hzb66

Associations of APOL1 Biallelic and Monoallelic Kidney Disease Variants with CKDs in West Africans: H3Africa KDRN Study

2024· article· en· W4403811363 sur OpenAlexaff
Rasheed Gbadegesin, Ifeoma Ulasi, Yemi Raheem Raji, Manmak Mamven, Adebowale Adeyemo, Titilayo O. Ilori, Adaobi Solarin, Paul L. Kimmel, Frank C. Brosius, Matthias Kretzler, Jeffrey B. Hodgin, Martin R. Pollak, Barry I. Freedman, Winfred W. Williams, Rulan S. Parekh, D. Adu, Akinlolu Ojo

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensWomen's College Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKidney diseaseGeneticsDiseaseBiologyKidneyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Background: Apolipoprotein L1 gene (APOL1) variants are risk factors for chronic kidney disease (CKD) among African Americans (AA). Data are sparse on the genetic epidemiology and clinical association of APOL1 variants with CKD in West Africans, a major group among the AA population. Methods: The Human Health and Heredity in Africa (H3Africa) Kidney Disease Research Network studied 8,355 participants from Ghana and Nigeria: 4,712 participants with CKD stages 2-5, 866 participants with biopsy proven glomerular diseases, and 2777 controls (eGFR ≥90 ml/min/1.73m2 and no proteinuria). The association of CKD with high-risk carriers (two APOL1 alleles) and low-risk carriers (<2 APOL1 alleles) was determined by fitting logistic regression models controlling for covariates, including clinical site, age, and sex. Results: Monoallelic and biallelic APOL1 variant prevalence were 43.0% and 29.7%, respectively. Compared with low-risk carriers, the adjusted odds of CKD and focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) among high-risk carriers were 1.25 (95%CI: 1.11-1.40) and 1.84 (95%CI 1.30-2.61), respectively. Compared with those with no APOL1 variant (G0/G0), persons with one APOL1 variant (G0/G1, G0/G2) had higher odds of CKD (OR 1.18, 95% CI 1.04-1.33) and FSGS (adjusted OR 1.61; 95% CI 1.04-2.48). Covariates did not modify the association of 1-2 APOL1 variants with CKD or FSGS. Conclusion: Both monoallelic (G1/G0, G2/G0) and biallelic (G1/G1, G2/G2, G1/G2) risk variants have 18% and 25% higher odds of CKD, and 61% and 84% higher odds of FSGS, respectively. Individuals with monoallelic APOL1 variant should be classified as being at high risk for CKD and FSGS. Funding: NIDDK Support - NIDDK Support, NIDDK Support

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of Nephrology→Même sujetRenal Diseases and Glomerulopathies→Travaux en français237 207→