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Enregistrement W4403811505 · doi:10.1681/asn.202421s12k91

Mitochondrial DNA Copy Number Is Associated with Incident AKI, CKD, and Inflammatory Biomarkers

2024· article· en· W4403811505 sur OpenAlexaffabout
Pukhraj S. Gaheer, Giuliano Caltagirone, Adeera Levin, Wei Q. Deng, Michael Chong, Matthew B. Lanktree

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial DNAMedicineBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Mitochondrial DNA copy number (mtDNA-CN) is an estimate of the number of mitochondria per leukocyte and a surrogate measure of net mitochondrial function. Reduced mtDNA-CN has been reported associated with diabetes, cardiovascular disease, and CKD. We sought to evaluate the association of blood mtDNA-CN with incident acute kidney injury (AKI), CKD, and inflammatory biomarkers. Methods: mtDNA-CN was estimated from whole-genome sequencing data in the UK Biobank cohort, consisting of 38,440 samples from the general population. We estimated mtDNA-CN using a quantitative polymerase chain reaction (qPCR) in the Canadian study of prediction of death, dialysis, and interim cardiovascular events (CanPREDDICT) cohort, consisting of 1,435 patients with advanced CKD. Linear and Cox proportional hazard regressions were adjusted for blood cell counts, age, sex, and comorbidities. We also used two-sample Mendelian randomization to test if genetically predicted mtDNA-CN was associated with eGFR. Reverse Mendelian randomization tested the opposite direction: if genetically predicted kidney function was associated with mtDNA-CN. Results: In the UK Biobank, we observed a 12% higher risk of incident AKI (hazard ratio (HR)=0.88, 95% CI = 0.86–0.91, P=2.4x10-6) and 8% increased odds of incident CKD (odds ratio=0.92, 95% CI = 0.89-0.94, P=0.0008) per 1 standard deviation (SD) decrease in mtDNA-CN while adjusting for baseline eGFR. Meta-analyzing across CanPREDDICT and UK Biobank revealed a 16% higher risk of incident kidney failure (HR=0.84, 95% CI = 0.76-0.93; P=0.0006) and a 3% increase in uACR (95% CI = 1%-5%, P=0.002) per 1 SD decrease in mtDNA-CN. In CanPREDDICT, mtDNA-CN was also associated with transforming growth factor-ß1 (TGFß1, ß=-9.5% per 1 SD decrease, P=0.0005) and C reactive protein (CRP, ß=8.9% per 1 SD decrease, P=0.005). Bidirectional Mendelian randomization analysis did not support either mtDNA-CN or eGFR as causally impacting the other (P>0.05). Conclusion: mtDNA-CN was associated with incident AKI, CKD, and kidney failure, as well as pro-inflammatory markers TGFß1 and CRP. However, Mendelian randomization analysis did not support a causal relationship between kidney function and mtDNA-CN, suggesting a separate causal pathway mediates the association. Funding: Government Support – Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
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