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Enregistrement W4403831576 · doi:10.1681/asn.2024r2n65jyk

Geospatial Mapping to Identify Primary Glomerulonephritis Hot Spots in Saskatchewan

2024· article· en· W4403831576 sur OpenAlexaffabout
Bhanu Prasad, Aditi Sharma, Aarti Garg, Abdul Raouf, Matthew Patterson, Pouneh Dokouhaki

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of SaskatchewanSaskatchewan PolytechnicUniversity of ReginaRegina General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeospatial analysisGlomerulonephritisPrimary (astronomy)MedicineGeographyCartographyInternal medicineKidney

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Saskatchewan (SK), a province rich in oil, minerals, and agriculture, with 1.2M population, is principally served by its two urban renal centers in Regina and Saskatoon. There is a lack of comprehensive data on the association of GN subtypes with rural-urban divide, and geographic hotspots like mines and refineries.Utilizing the kidney biopsy, our objective was to identify clusters of GN subtypes, calculate yearly incidence rates, urban/rural comparisons, and distance and travel time to access care. Methods: A centralized provincial kidney pathology database was used to capture all incident cases of biopsy-proven GN in the adult population from 2002 - 2018. Only patients with primary GN were included (n=1372). Demographic attributes, 3-digit postal codes, lab parameters, definitive GN diagnosis, the date of biopsy, dialysis start, and death were collected and analyzed. To analyze the variation of GN across different regions in SK we used SaTScan v10.1.3 software. The population data from Census 2016 was used as a reference, and age and sex were taken as covariates. Results: GN incidence increased from 4.6 to 13.6 per 100,000 persons from 2002 to 2018 (p<0.001). GN incidence was higher in rural areas than in urban areas (p<0.001). Significantly higher dialysis progression rates were seen for rural and remote areas (p<0.01). We identified a geospatial cluster of 345.7 km2 for lupus nephropathy (Figure 1(f)), with an incident rate ratio of 1.73, a relative risk of 2.7, and a Log likelihood ratio of 13.87. No significant clusters were identified for any other subtypes of GN. Conclusion: We identified a geographic cluster for lupus nephropathy, encompassing both urban and rural areas. While there was a higher incidence of MN and AGBM in rural areas, we did not identify any geographic clusters for the same. Addressing and understanding the multifaceted factors driving these disparities are essential steps towards easing the burden of GN on impacted communities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,184

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0040,009
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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