Contrast and Genomic Characterisation of Ancient and Recent Interspecific Introgression Between Deeply Diverged Moustache Toads (<i>Leptobrachium</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Recent genomic analyses have provided new insights into the process of interspecific introgression and its consequences on species evolution. Most recent studies, however, focused on hybridization between recently radiated species, with few examining the genomic outcomes of ancient hybridization across deeply diverged species. Using whole genome data of moustache toads (Leptobrachium), we identified signals of three hybridization events among nine species that diverged at the Eocene. An ancient introgression from L. leishanense to the ancestral branch (C1) of L. liui introduced adaptive variants. The highly introgressed regions include genes with important functions in odorant detection and immune responses. These genes are preserved in all three descendent populations of L. liui_C1, and these regions likely have been positively selected over a long filtering process. A recent introgression occurred from L. huashen to L. tengchongense, with the introgressed regions being mostly neutral. Furthermore, one F1 hybrid individual was detected between sympatric L. ailaonicum and L. promustache. The signals of introgression largely disappeared after removing the hybrid individual, indicating an occasional hybridization but minimal introgression. Further examination of highly divergent but low introgressed genomic regions revealed both pre-mating isolation and genetic incompatibility as potential mechanisms of resisting introgression and maintaining species boundaries. Additionally, no large X-effect was found in these introgression events. Hybridization between deeply diverged amphibian species may be common, but detectable introgressions are likely less so, with recent introgression being mostly neutral and the rare ancient one potentially adaptive. Our findings complement recent genomic work, and together they provide a better understanding of the genomic characteristics of interspecific introgression and its significance in species adaptation and evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».