Clinical epidemiology and impact of Haemophilus influenzae airway infections in adults with cystic fibrosis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Haemophilus influenzae is prevalent within the airways of persons with cystic fibrosis (pwCF). H. influenzae is often associated with pulmonary exacerbations (PEx) in pediatric cohorts, but in adults, studies have yielded conflicting reports around the impact(s) on clinical outcomes such as lung function decline. Accordingly, we sought to discern the prevalence, natural history, and clinical impact of H. influenzae in adult pwCF. METHODS: This single-centre retrospective cohort study reviewed all adult pwCF with H. influenzae sputum cultures between 2002 and 2016. From this cohort, persistently infected subjects (defined as: ≥2 samples with the same pulsotype and > 50% sputum culture-positive for H. influenzae in each year) were matched (1:2) to controls without H. influenzae. Demographic and clinical status (baseline health or during periods of PEx) were obtained at each visit that H. influenzae was cultured. Yearly biobank isolates were typed using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) to assess relatedness. RESULTS: Over the study period, 30% (n = 70/240) of pwCF were culture positive for H. influenzae, of which 38 (54%) were culture-positive on multiple occasions and 12 (17%) had persistent infection. One hundred and thirty-seven isolates underwent PFGE, with 94 unique pulsotypes identified. Two (1.5%) were serotype f with the rest non-typeable (98.5%). H. influenzae isolation was associated with an increased risk of PEx (RR = 1.61 [1.14-2.27], p = 0.006), however, this association was lost when we excluded those who irregularly produced sputum (i.e. only during a PEx). Annual lung function decline did not differ across cohorts. CONCLUSIONS: Isolation of H. influenzae was common amongst adult pwCF but often transient. H. influenzae infection was not associated with acute PEx or chronic lung function decline.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».