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Enregistrement W4403852334 · doi:10.1172/jci179501

Immunological and molecular features of the tumor microenvironment of long-term survivors of ovarian cancer

2024· article· en· W4403852334 sur OpenAlexafffundabout
Brad H. Nelson, Phineas T. Hamilton, Minh Tung Phung, Katy Milne, Bronwyn Harris, Shelby Thornton, Donald L.I. Stevens, Shreena Kalaria, Karanvir Singh, Céline M. Laumont, Elena Moss, Aliya Alimujiang, Nicola S. Meagher, Adelyn Bolithon, Sián Fereday, Catherine J. Kennedy, Joy Hendley, Dinuka Ariyaratne, Kathryn Alsop, Nadia Traficante, Ellen L. Goode, Anthony N. Karnezis, Hui Shen, Jean L. Richardson, Cindy McKinnon Deurloo, Anne Chase, Bronwyn Grout, Jennifer A. Doherty, Holly R. Harris, Kara L. Cushing‐Haugen, Michael S. Anglesio, Karolin Heinze, David G. Huntsman, Aline Talhouk, Gillian E. Hanley, Jennifer Alsop, Mercedes Jimenez-Linan, Paul D.P. Pharoah, Jessica Boros, Alison H. Brand, Paul R. Harnett, Raghwa Sharma, Jonathan L. Hecht, Naoko Sasamoto, Kathryn L. Terry, Beth Y. Karlan, Jenny Lester, Michael E. Carney, Marc T. Goodman, Brenda Y. Hernandez, Lynne R. Wilkens, Sabine Behrens, Renée T. Fortner, Peter A. Fasching, Christiani Bisinotto, Francisco José Cândido dos Reis, Prafull Ghatage, Martin Köbel, Esther Elishaev, Francesmary Modugno, Linda S. Cook, Nhu D. Le, Aleksandra Gentry‐Maharaj, Usha Menon, María J. García, Cristina Rodríguez‐Antona, Kyo Farrington, Linda E. Kelemen, Stefan Kommoss, Annette Staebler, Dale W. Garsed, James D. Brenton, Anna Piskorz, David D.L. Bowtell, Anna DeFazio, Susan J. Ramus, Malcolm C. Pike, Celeste Leigh Pearce

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensWomen's Health Research InstituteBC Cancer AgencyFoothills Medical CentreVancouver General HospitalUniversity of CalgaryUniversity of VictoriaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandCongressionally Directed Medical Research ProgramsNational Cancer InstituteInstituto de Salud Carlos IIICancer Council TasmaniaCancer Council VictoriaNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilFoundation MedicineNational Institutes of HealthPeter MacCallum FoundationCanadian Institutes of Health ResearchCancer Institute NSWTerry Fox Research InstituteCancer Council Western AustraliaCancer AustraliaBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchCancer Council NSWMarshfield Clinic Research FoundationOvarian Cancer AustraliaGenome British ColumbiaFred C. and Katherine B. Andersen FoundationMayo Foundation for Medical Education and ResearchDeutsche ForschungsgemeinschaftVGH and UBC Hospital FoundationFriedrich-Alexander-Universität Erlangen-NürnbergCancer Council South AustraliaDeutsches KrebsforschungszentrumCancer Council QueenslandMinisterio de Economía y CompetitividadUniversity of PittsburghVictorian Cancer AgencyNational Health and Medical Research CouncilAstraZenecaPfizerNational Center for Research ResourcesBC Cancer FoundationOak FoundationCancer Research UKMinnesota Ovarian Cancer AllianceU.S. Department of Defense
Mots-clésTerm (time)CancerOvarian cancerTumor microenvironmentCancer researchMedicineOncologyBiologyImmunologyBioinformaticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUNDDespite an overall poor prognosis, about 15% of patients with advanced-stage tubo-ovarian high-grade serous carcinoma (HGSC) survive 10 or more years after standard treatment.METHODSWe evaluated the tumor microenvironment of this exceptional, understudied group using a large international cohort enriched for long-term survivors (LTS; 10+ years; n = 374) compared with mid-term (MTS; 5-7.99 years; n = 433) and short-term survivors (STS; 2-4.99 years; n = 416). Primary tumor samples were immunostained and scored for intraepithelial and intrastromal densities of 10 immune-cell subsets (including T cells, B cells, plasma cells, myeloid cells, PD-1+ cells, and PD-L1+ cells) and epithelial content.RESULTSPositive associations with LTS compared with STS were seen for 9 of 10 immune-cell subsets. In particular, the combination of intraepithelial CD8+ T cells and intrastromal B cells showed near 5-fold increased odds of LTS compared with STS. All of these associations were stronger in tumors with high epithelial content and/or the C4/Differentiated molecular subtype, despite immune-cell densities generally being higher in tumors with low epithelial content and/or the C2/Immunoreactive molecular subtype.CONCLUSIONThe tumor microenvironment of HGSC LTS is distinguished by the intersection of T and B cell coinfiltration, high epithelial content, and C4/differentiated molecular subtype, features which may inspire new approaches to immunotherapy.FUNDINGOvarian Cancer Research Program (OCRP) of the Congressionally Directed Medical Research Program (CDMRP), U.S. Department of Defense (DOD); American Cancer Society; BC Cancer Foundation; Canada's Networks of Centres of Excellence; Canadian Cancer Society; Canadian Institutes of Health Research; Cancer Councils of New South Wales, Victoria, Queensland, South Australia, and Tasmania, Cancer Foundation of Western Australia; Cancer Institute NSW; Cancer Research UK; Deutsche Forschungsgesellschaft; ELAN Funds of the University of Erlangen-Nuremberg; Fred C. and Katherine B. Andersen Foundation; Genome BC; German Cancer Research Center; German Federal Ministry of Education and Research, Programme of Clinical Biomedical Research; Instituto de Salud Carlos III; Mayo Foundation; Minnesota Ovarian Cancer Alliance; Ministerio de Economía y Competitividad; Medical Research Council (MRC); National Center for Advancing Translational Sciences; National Health and Medical Research Council of Australia (NHMRC); Ovarian Cancer Australia; Peter MacCallum Foundation; Sydney West Translational Cancer Research Centre; Terry Fox Research Institute; The Eve Appeal (The Oak Foundation); UK National Institute for Health Research Biomedical Research Centres at the University of Cambridge; University of Pittsburgh School of Medicine; U.S. National Cancer Institute of the National Institutes of Health; VGH & UBC Hospital Foundation; Victorian Cancer Agency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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