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Enregistrement W4403866051 · doi:10.1099/ijsem.0.006565

Description of Millerago gen. nov. based on taxogenomic analysis, with two new species, Millerago phaffii f.a., sp. nov. and Millerago galiae f.a., sp. nov.

2024· article· en· W4403866051 sur OpenAlexafffund
Ángela M. García‐Acero, Thiago Mafra Batista, Gisele F. L. Souza, Ana Raquel O. Santos, Daniela L. Souza, Glória Regina Franco, Mario Enrique Velásquez-Lozano, Daichi Yamamoto, Wataru Toki, Marc-André Lachance, Carlos A. Rosa

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mots-clésBiologyIndelCladeInternal transcribed spacerBotanyPhylogenetic treeGenusRibosomal RNAGeneGeneticsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An erratum of this article has been published full details can be found at https://doi.org/10.1099/ijsem.0.006591 Four yeast isolates obtained from tree bark and fermenting sap of Quercus spp. and insects in Colombia and Japan were phylogenetically related to Candida galis based on analyses of the sequences of the internal transcribed spacer (ITS) region and the D1/D2 domains of the large subunit rRNA gene. The novel species differs from C. galis by 20 nt substitutions and 5 indels in the D1/D2 sequences. A phylogenomic analysis suggested that these species are related to Candida ficus , the genus Phaffomyces and a small clade containing Barnettozyma botsteinii , Barnettozyma siamensis and Candida montana . Our genomic analyses suggest that the novel species and C. galis should be separated in a novel yeast genus. We propose the genus Millerago gen. nov. to accommodate these species and the species Millerago phaffii f.a., sp. nov. (CBS 18021 T ; MycoBank MB856172) to accommodate the Colombian and Japanese isolates. The Colombian isolate of M. phaffii differs from the Japanese isolates by three nt substitutions and one indel and two substitutions and one indel in the ITS and D1/D2 sequences, respectively, showing that they were conspecific. We also propose the new species Millerago galiae sp. nov. to validate this species according to the rules of the International Code of Nomenclature for algae, fungi and plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,828
Score d'incertitude au seuil0,853

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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