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Enregistrement W4403888137 · doi:10.21105/joss.06963

OpenCCM: An Open-Source Continuous CompartmentalModelling Package

2024· article· en· W4403888137 sur OpenAlexafffund
Alexandru Andrei Vasile, Matthew Peres Tino, Yuvraj Aseri, Nasser Mohieddin Abukhdeir

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Open Source Software · 2024
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueModel Reduction and Neural Networks
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlliance de recherche numérique du Canada
Mots-clésR packageOpen sourceComputer scienceComputational scienceProgramming languageSoftware

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OpenCCM is a compartmental modelling (Jourdan et al., 2019) software package based on recently developed fully automated flow alignment compartmentalization methods (Vasile et al., 2024).It is primarily intended for large-scale flow-based processes with weak coupling between composition changes, e.g., through (bio)chemical reactions, and convective mass transport in the system.Compartmental modelling is an important approach used to develop reduced-order models (Benner et al., 2020;Chinesta et al., 2017) using a priori knowledge of process hydrodynamics (Jourdan et al., 2019).Compartmental modelling methods, such as those implemented in OpenCCM, enable simulations of these processes with far less computational complexity while still capturing the key aspects of process dynamics.OpenCCM integrates with two multiphysics simulation software packages, OpenCMP (Monte et al., 2022) and OpenFOAM (Greenshields, 2024), allowing for ease of transferring simulation data for compartmentalization. Additionally, it provides users with built-in functionality for computing residence times and exporting for use in other simulation or visualization software, including ParaView (Ayachit, 2015).Post-processing methods are included for mapping simulation results from compartment domains to the original simulation domain, which are useful for visualization purposes and for further simulations in using other software (e.g., multi-scale modelling).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,130

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0060,003
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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