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Enregistrement W4403889633 · doi:10.1128/jvi.01432-24

Electron tomography visualization of HIV-1 virions trapped by fusion inhibitors to host cells in infected tissues

2024· article· en· W4403889633 sur OpenAlexfundno aff
Mark S. Ladinsky, Li Zhu, Irfan Ullah, Pradeep D. Uchil, Priti Kumar, Michael S. Kay, Pamela J. Björkman

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthCalifornia Institute of Technology
Mots-clésBiologyLipid bilayer fusionCell fusionViral entryViral envelopeCell biologyCellReceptorCell membraneBiophysicsTransmembrane proteinVirologyViral replicationVirusBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT HIV-1 delivers its genetic material to infect a cell after fusion of the viral and host cell membranes, which takes place after the viral envelope (Env) binds host receptor and co-receptor proteins. Binding of host receptor CD4 to Env results in conformational changes that allow interaction with a host co-receptor (CCR5 or CXCR4). Further conformational rearrangements result in an elongated pre-hairpin intermediate structure in which Env is anchored to the viral membrane by its transmembrane region and to the host cell membrane by its fusion peptide. Although budding virions can be readily imaged by electron tomography (ET) of HIV-1-infected tissues and cultured cells, virions that are fusing (attached to host cells via pre-hairpin intermediates) are not normally visualized, perhaps because the process of membrane fusion is too fast to capture by ET. To image virions during fusion, we used fusion inhibitors to prevent downstream conformational changes in Env that lead to membrane fusion, thereby trapping HIV-1 virions linked to target cells by pre-hairpin intermediates. ET of HIV-1 pseudovirions bound to CD4 + /CCR5 + TZM-bl cells revealed presumptive pre-hairpin intermediates as 2–4 narrow spokes linking a virion to the cell surface. To extend these results to a more physiological setting, we used ET to image tissues and organs derived from humanized bone marrow/liver/thymus mice infected with HIV-1 and then treated with CPT31, a high-affinity D-peptide fusion inhibitor linked to cholesterol. Trapped HIV-1 virions were found in all tissues studied (small intestine, mesenteric lymph nodes, spleen, and bone marrow), and spokes representing pre-hairpin intermediates linking trapped virions to cell surfaces were similar in structure and number to those seen in the previous pseudovirus and cultured cell ET study. IMPORTANCE Trapped and untrapped HIV-1 virions, both mature and immature, were distinguished by localizing spokes via 3D tomographic reconstructions of HIV-1 infected and fusion-inhibitor-treated tissues of humanized mice. The findings of trapped HIV-1 virions in all tissues examined demonstrate a wide distribution of the CPT31 inhibitor, a desirable property for a potential therapeutic. In addition, the presence of virions trapped by spokes, particularly in vascular endothelial cells, demonstrates that the fusion inhibitors can be used as markers for potential HIV-1-target cells within tissues, facilitating the mapping of HIV-1 target cells within the complex cellular milieu of infected tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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