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Enregistrement W4403896030 · doi:10.1242/jcs.262322

The crucial role of bioimage analysts in scientific research and publication

2024· article· en· W4403896030 sur OpenAlexfundno aff
Beth A. Cimini, Peter Bankhead, Rocco D’Antuono, Elnaz Fazeli, Julia Fernández-Rodrı́guez, Caterina Fuster-Barceló, Robert Haase, Helena Jambor, Martin L. Jones, Florian Jug, Anna H. Klemm, Anna Kreshuk, Stefania Marcotti, Gabriel G. Martins, Sara McArdle, Kota Miura, Arrate Muñoz‐Barrutia, Laura C. Murphy, Michael S. Nelson, Simon F. Nørrelykke, Perrine Paul‐Gilloteaux, Thomas Pengo, Joanna W. Pylvänäinen, Lior Pytowski, Arianna Ravera, Annika Reinke, Yousr Rekik, Caterina Strambio‐De‐Castillia, Daniel Thédié, Virginie Uhlmann, Oliver Umney, L. F. Wiggins, Kevin W. Eliceiri

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Human Genome Research InstituteAgencia Estatal de InvestigaciónWellcome TrustCancer Research UKBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthBiocenter FinlandScience for Life LaboratoryEuropean Regional Development FundUniversität ZürichBundesministerium für Bildung und ForschungCompany of BiologistsUniversity of LeedsAcademy of FinlandUniversity of EdinburghSilicon Valley Community FoundationHelsingin YliopistoEuropean CommissionNational Institute of General Medical SciencesFrancis Crick InstituteMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesMedical Research CouncilChan Zuckerberg InitiativeNational Cancer InstituteHORIZON EUROPE Framework ProgrammeAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésCategorizationPerspective (graphical)Value (mathematics)Data scienceQuality (philosophy)Knowledge managementAction (physics)BiologyEngineering ethicsComputer scienceArtificial intelligenceEpistemologyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bioimage analysis (BIA), a crucial discipline in biological research, overcomes the limitations of subjective analysis in microscopy through the creation and application of quantitative and reproducible methods. The establishment of dedicated BIA support within academic institutions is vital to improving research quality and efficiency and can significantly advance scientific discovery. However, a lack of training resources, limited career paths and insufficient recognition of the contributions made by bioimage analysts prevent the full realization of this potential. This Perspective - the result of the recent The Company of Biologists Workshop 'Effectively Communicating Bioimage Analysis', which aimed to summarize the global BIA landscape, categorize obstacles and offer possible solutions - proposes strategies to bring about a cultural shift towards recognizing the value of BIA by standardizing tools, improving training and encouraging formal credit for contributions. We also advocate for increased funding, standardized practices and enhanced collaboration, and we conclude with a call to action for all stakeholders to join efforts in advancing BIA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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