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Enregistrement W4403896919 · doi:10.1093/aje/kwae423

Addressing bias due to measurement error of an outcome with unknown sensitivity in database epidemiologic studies. A contribution from the ConcePTION project

2024· article· en· W4403896919 sur OpenAlexaff
Giorgio Limoncella, Leonardo Grilli, Emanuela Dreassi, Carla Rampichini, Robert W. Platt, Rosa Gini

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Epidemiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClinical Laboratory Practices and Quality Control
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesEuropean CommissionEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and Associations
Mots-clésEpidemiologySensitivity (control systems)MedicineObservational errorStatisticsPathologyMathematicsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In epidemiologic database studies, the occurrence of an event is measured with error through an indicator whose specificity is often maximized, at the expense of sensitivity. However, if the indicator has low sensitivity, measures of occurrence are underestimated. In association studies, risk difference is biased, and risk ratio may be biased as well, in either direction, if the sensitivity is differential across exposure groups. In this work, we show that if an auxiliary screening indicator can be defined to complement the main indicator, estimates of the positive predictive value of both indicators provide tools to estimate the sensitivity of the primary indicator or a lower bound thereof. This mitigates bias in estimating the number of cases, prevalence, cumulative incidence, rate (particularly when the event is rare), and, in association studies, risk ratio and risk difference. They also allow testing for nondifferential sensitivity. Although direct estimation of sensitivity is often infeasible, this novel methodology improves evidence based on data obtained from reuse of existing databases, which may prove critical for regulatory and public health decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,373
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,727
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,627
Score d'incertitude au seuil0,773

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3730,727
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0050,007
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0080,006
Science ouverte0,0040,008
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,572
Tête enseignante GPT0,543
Écart entre enseignants0,029 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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