Compositional diversity of minimal coacervates in a nucleic acid-peptide world
Notice bibliographique
Résumé
The early co-evolution of RNA and peptides is at the core of the RNA-peptide world hypothesis. Recent studies suggest that nucleotides and amino acids could have formed and polymerised non-enzymatically under prebiotic conditions, generating short oligonucleotides and peptides capable of non-enzymatic RNA replication and peptide synthesis. However, whether the cooperation between nucleic acids and peptides stems from their co-localisation in primitive compartments is unclear. Here we demonstrate the early and likely inevitable emergence of primitive coacervates via liquid-liquid phase separation of prebiotic heterogeneous mixtures of short non-coded oligonucleotides and peptides. We show that peptide/nucleic acid coacervates are more prone to form than peptide/peptide coacervates, and that peptide/RNA coacervates are remarkably more stable than peptide/DNA coacervates. Atomistic simulations confirm that the more extended and less structured conformation of RNA over DNA enables more contact points with peptides. The more abundant interactions in peptide/RNA coacervates lead to enhanced salt and thermal stability, yet reduced fluidity compared to their DNA counterparts - which are in turn capable to fully preserve RNA secondary structure upon partitioning. Our findings suggest that peptide/oligonucleotide co-localisation via coacervation would have inevitably occurred at an early stage of a more holistic nucleic acid-peptide world scenario. Both RNA and DNA would have thus been required to ensure the emergence of coacervates with balanced stability and fluidity to host non-enzymatic RNA chemistry.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».