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Enregistrement W4403908157 · doi:10.1101/2024.10.28.24316295

Multidimensional Epigenetic Clocks Reveal Physiological System-Specific Aging in Schizophrenia

2024· preprint· en· W4403908157 sur OpenAlexaff
Zachary M. Harvanek, Raghav Sehgal, Daniel S. Borrus, Jessica Kasamoto, Ryan Smith, Michael J. Corley, Christiaan H. Vinkers, Marco P. Boks, Varun B. Dwaraka, Jessica Lasky‐Su, Albert Higgins‐Chen

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCytodiagnostics (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSchizophrenia (object-oriented programming)Meta-analysisEpigeneticsPsychologyComputer scienceCognitive psychologyNeuroscienceBiologyMedicinePsychiatryGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

IMPORTANCE: Schizophrenia is associated with increased age-related morbidity, mortality, and frailty, which are not entirely explained by behavioral factors. Prior studies using epigenetic clocks have suggested that schizophrenia is associated with accelerated aging, however these studies have primarily used unidimensional clocks that summarize aging as a single "biological age" score. OBJECTIVE: This meta-analysis uses multidimensional epigenetic clocks that split aging into multiple scores to analyze biological aging in schizophrenia. These novel clocks may provide more granular insights into the mechanistic relationships between schizophrenia, epigenetic aging, and premature morbidity and mortality. STUDY SELECTION: Selected studies included patients with schizophrenia-spectrum disorders and non- psychiatric controls with available DNA methylation data. Seven cross-sectional datasets were available for this study, with a total sample size of 1,891 patients with schizophrenia and 1,881 controls. DATA EXTRACTION AND SYNTHESIS: Studies were selected by consensus Meta-analyses were performed using fixed-effect models. MAIN OUTCOMES AND MEASURES: We analyzed multidimensional epigenetic clocks, including causality- enriched CausAge clocks, physiological system-specific SystemsAge clocks, RetroelementAge, DNAmEMRAge, and multi omics-informed OMICmAge. Meta-analyses examined clock associations with schizophrenia disease status and clozapine use, after accounting for age and sex. RESULTS: Overall SystemsAge, CausAge, DNAmEMRAge, and OMICmAge scores demonstrated increased epigenetic aging in patients with schizophrenia after strict multiple-comparison testing. Ten of the eleven SystemsAge sub-clocks corresponding to different physiological systems demonstrated increased aging, with strongest effects for Heart and Lung followed by Metabolic and Brain systems. The causality- enriched clocks indicated increases in both damaging and adaptive aging, though these effects were weaker compared to SystemsAge scores. OMICmAge indicated changes in multiple clinical biomarkers, including hematologic and hepatic markers that support system-specific aging, as well as novel proteins and metabolites not previously linked to schizophrenia. Most clocks demonstrated age acceleration at the first psychotic episode. Notably, clozapine use was associated with increased Heart and Inflammation aging, which may partially be driven by smoking. Most results survived strict Bonferroni multiple testing correction. CONCLUSIONS AND RELEVANCE: These are the first analyses of novel multidimensional clocks in patients with schizophrenia and provide a nuanced view of aging that identifies multiple organ systems at high risk for disease in schizophrenia-related disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,057

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,011
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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