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Enregistrement W4403912561 · doi:10.2196/52282

Differences in Messenger RNA Expression of Fibulin-1, Elastin, Matrix Metalloproteinase-1, Basic Fibroblast Growth Factor, and α-Smooth Muscle Actin Between the Ventral and Dorsal Tunica Dartos in Patients With Hypospadias and Chordee: Protocol for a Prospective Cohort Study

2024· article· en· W4403912561 sur OpenAlexvenueno aff
Joko Pitoyo, Alvarino, Eryati Darwin, Yanwirasti Yanwirasti

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrological Disorders and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypospadiasElastinChordeeMedicinePenisBiologyAnatomyCell biologyInternal medicinePathologyUrethraUrethroplasty

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hypospadias is a common congenital anomaly characterized by the displacement of the urethral opening to the ventral side of the penis. Surgical correction is often necessary for functional and psychological reasons. The etiology involves genetic and environmental factors, and chordee, a downward curvature of the penis, is a common complication. Proteins such as fibulin-1, elastin, matrix metalloproteinase-1, basic fibroblast growth factor, and α-smooth muscle actin play roles in hypospadias development. OBJECTIVE: The study's aim is to investigate the differences in messenger RNA (mRNA) expression of fibulin-1, elastin, matrix metalloproteinase-1, basic fibroblast growth factor, and α-smooth muscle actin between the ventral and dorsal tunica dartos in patients with hypospadias and chordee. METHODS: This prospective cohort study aims to investigate differences in mRNA expression of the abovementioned proteins between the ventral and dorsal tunica dartos in patients with hypospadias and chordee. Ethics approval has been obtained, and consent from parents will be obtained before data collection. Eligible participants are aged 6-18 months, diagnosed with hypospadias and chordee, and planned for urethroplasty. Tissue samples will be collected from both aspects of the tunica dartos and analyzed using real-time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction. Data analysis will involve statistical tests and normalization of housekeeping genes. RESULTS: This study is at the protocol development stage. A pilot study regarding its feasibility has been ongoing as of August 2023. The study results are expected to be available by the end of 2024. CONCLUSIONS: The study of mRNA expressions of various proteins in the tunica dartos of patients with hypospadias and chordee is expected to improve the understanding and expand the knowledge of the pathophysiology of hypospadias and chordee. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/52282.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,434
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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