Genetic variants in the PKD1L2/BCO1 region are associated with β-carotene, lutein, and zeaxanthin: A genome-wide association study of plasma carotenoids
Notice bibliographique
Résumé
• Plasma β-Carotene, Lutein, and Zeaxanthin concentrations were associated with PKD1L2/BCO1. • These genome-wide association study findings were not replicated in other ethnic groups. • Genetic variant-based nutrition recommendations may help optimize carotenoid intake. Carotenoid consumption has been associated with a reduced risk of several chronic diseases. Inter-individual genetic variation may explain some of the observed differences in plasma carotenoid concentrations between individuals. Identifying genetic variants associated with circulating carotenoids in young adults may help identify individuals at increased risk for developing conditions associated with low carotenoids later in life. We hypothesize that common genetic variants are associated with circulating carotenoid concentrations in a population of young adults. A genome-wide association study (GWAS) on plasma carotenoids (α-carotene, β-carotene, β-cryptoxanthin, lutein, and zeaxanthin) was conducted in Caucasians (n = 393) from the Toronto Nutrigenomics and Health Study. Replication cohorts included individuals of Caucasian (n = 193), East Asian (n = 436) and South Asian (n = 135) ethnicity. Linear regression adjusted for age, sex, BMI, total serum cholesterol, dietary carotenoid intake and population structure were used to identify associations between genetic variants and plasma carotenoids. Associations that met the threshold for genome-wide significance ( p < 5 × 10 -8 ) in unadjusted and partially adjusted models were not observed in the replication cohorts. No variants achieved genome-wide significance in fully adjusted models. Previously identified associations between variation in the PKD1L2/BCO1 region and β-carotene, lutein and zeaxanthin were replicated in the GWAS cohort ( p < .05). Established variation in the PKD1L2/BCO1 region is associated with plasma carotenoids. These variants may help to identify individuals who require greater amounts of these antioxidants and to provide precision nutrition recommendations for optimal intake of various carotenoids. A genome-wide association study investigating circulating plasma concentrations of common dietary carotenoids was conducted in a population of young adults. Genetic variation in the PKD1L2/BCO1 region was found to be associated with plasma concentrations of β-carotene, lutein, and zeaxanthin. Such variants may help to identify individuals who require greater amounts of these antioxidants and provide precision nutrition recommendations for optimal intake of various carotenoids.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».