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Enregistrement W4403925131 · doi:10.1126/science.adp8721

Brain malformations and seizures by impaired chaperonin function of TRiC

2024· article· en· W4403925131 sur OpenAlexafffund
Florian Kraft, Piere Rodriguez-Aliaga, Weimin Yuan, Kamil K. Zajt, Dimah Hasan, Ting-Ting Lee, Elisabetta Flex, Andreas Hentschel, A. Micheil Innes, Bixia Zheng, Dong Sun Julia Suh, Cordula Knopp, Eva Lausberg, Jeremias Krause, Xiaomeng Zhang, Pamela Trapane, Martin A. McClatchey, Andrew E. Fry, Lisa Wang, Sebastian Gießelmann, Hieu D. Hoang, Dustin Baldridge, Gary A. Silverman, Francesca Clementina Radio, Enrico Bertini, Andrea Ciolfi, Katherine A Blood, Jean‐Madeleine de Sainte Agathe, Perrine Charles, Gaber Bergant, Goran Čuturilo, Borut Peterlin, Karin E. M. Diderich, Haley Streff, Laurie Robak, Renske Oegema, Ellen van Binsbergen, John Herriges, Carol Saunders, Andrea Maier, Stefan Wolking, Yvonne Weber, Hanns Lochmüller, Stefanie Meyer, Alberto Alemán, Kiran Polavarapu, Gaël Nicolas, Alice Goldenberg, Lucie Guyant, Kathleen Pope, Katherine N. Hehmeyer, Kristin G. Monaghan, Annegret Quade, Thomas Smol, Roseline Caumes, Sarah Duerinckx, Chantal Depondt, Wim Van Paesschen, Claudine Rieubland, Claudia Poloni, Michel Guipponi, Séverine Arcioni, Marije Meuwissen, Anna Jansen, Jessica Rosenblum, Tobias B. Haack, Miriam Bertrand, Lea Gerstner, Janine Magg, Olaf Rieß, Jörg B. Schulz, Norbert Wagner, Martin Wiesmann, Joachim Weis, Thomas Eggermann, Matthias Begemann, Andreas Roos, Martin Häusler, Tim Schedl, Marco Tartaglia, Juliane Bremer, Stephen C. Pak, Judith Frydman, Miriam Elbracht, Ingo Kurth

Notice bibliographique

RevueScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of British ColumbiaAlberta Children's Hospital
Organismes subventionnairesOffice of Research Infrastructure Programs, National Institutes of HealthGovernment of CanadaNational Institute of Child Health and Human DevelopmentDepartment of Health and Social CareMedical Research Council CanadaMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchRWTH Aachen UniversityMinistero della SaluteNational Institutes of HealthCanada First Research Excellence FundCanada Research ChairsChildren's Hospital FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Institute of General Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchOxford Nanopore TechnologiesWellcome TrustCancer Research UKHereditary Disease FoundationEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentEuropean CommissionChildren's Discovery InstituteMinisterium für Kultur und Wissenschaft des Landes Nordrhein-Westfalen
Mots-clésChaperoninNeuroscienceBrain functionEpilepsyBiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malformations of the brain are common and vary in severity, from negligible to potentially fatal. Their causes have not been fully elucidated. Here, we report pathogenic variants in the core protein-folding machinery TRiC/CCT in individuals with brain malformations, intellectual disability, and seizures. The chaperonin TRiC is an obligate hetero-oligomer, and we identify variants in seven of its eight subunits, all of which impair function or assembly through different mechanisms. Transcriptome and proteome analyses of patient-derived fibroblasts demonstrate the various consequences of TRiC impairment. The results reveal an unexpected and potentially widespread role for protein folding in the development of the central nervous system and define a disease spectrum of "TRiCopathies."

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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