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Enregistrement W4403934299 · doi:10.1101/2024.10.29.620938

A Protocol for Neuralized Murine Olfactory Organoids

2024· preprint· en· W4403934299 sur OpenAlexaff
Alp Özgün, Priya Suman, Josée Coulombe, Earl G. Brown, Julianna J. Tomlinson, John Woulfe, Michael G. Schlossmacher

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueOlfactory and Sensory Function Studies
Établissements canadiensUniversity of OttawaOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrganoidProtocol (science)Olfactory systemComputer scienceBiologyCell biologyNeuroscienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chronic olfactory dysfunction can be associated with parkinsonism, dementia, demyelinating disorders and schizophrenia. The olfactory epithelium (OE) represents an interface between the environment and the central nervous system. Mounting evidence implicates environmental factors in neurodegenerative disease processes, necessitating investigations into their interactions with the host’s genome. In Parkinson disease, hyposmia often precedes motor symptoms, raising the possibility that the OE could be involved in disease initiation. We previously demonstrated abundant α-synuclein expression in mammalian OE as well as aggregate formation in the olfactory nerve. Current in vitro models of OE are limited, relying primarily on post-mitotic cultures established from biopsies. To address this gap, we present a method for generating olfactory organoids of OE from adult mice. These organoids comprise neuronal and non-neuronal cell types, including sustentacular cells, thus encompassing structural elements of OE in situ . Expression of the olfactory sensory neuron marker OMP and Parkinson’s-linked α-synuclein was also detected in olfactory organoids, highlighting their potential usefulness to mechanistic research. We established OE organoids that were kept in culture for up to 3 weeks. In addition, we inoculated organoids with the neurotropic vesicular stomatitis virus to model infections. We conclude that this olfactory organoid model system offers a new platform for studying airborne environmental factors in their interactions with a genetically defined host; this, to study OE biology and enable the exploration of disease processes within olfactory tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,133
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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