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Enregistrement W4403936360 · doi:10.1371/journal.pcbi.1012464

Enhancing insights in sexually transmitted infection mapping: Syphilis in Forsyth County, North Carolina, a case study

2024· article· en· W4403936360 sur OpenAlexaff
Lani Fox, William C. Miller, Dionne Gesink, Irene A. Doherty, Marc L. Serre

Notice bibliographique

RevuePLoS Computational Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDivision of Microbiology and Infectious Diseases, National Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésOutbreakSyphilisGeolocationGeographyDemographyCongenital syphilisComputer scienceMedicineVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 2008-2011 Forsyth County, North Carolina (NC) experienced a four-fold increase in syphilis rising to over 35 cases per 100,000 mirroring the 2021 state syphilis rate. Our methodology extends current models with: 1) donut geomasking to enhance resolution while protecting patient privacy; 2) a moving window uniform grid to control the modifiable areal unit problem, edge effect and remove kriging islands; and 3) mitigating the "small number problem" with Uniform Model Bayesian Maximum Entropy (UMBME). Data is 2008-2011 early syphilis cases reported to the NC Department of Health and Human Services for Forsyth County. Results were assessed using latent rate theory cross validation. We show combining a moving window and a UMBME analysis with geomasked data effectively predicted the true or latent syphilis rate 5% to 26% more accurate than the traditional, geopolitical boundary method. It removed kriging islands, reduced background incidence rate to 0, relocated nine outbreak hotspots to more realistic locations, and elucidated hotspot connectivity producing more realistic geographical patterns for targeted insights. Using the Forsyth outbreak as a case study showed how the outbreak emerged from endemic areas spreading through sexual core transmitters and contextualizing the outbreak to current and past outbreaks. As the dynamics of sexually transmitted infections spread have changed to online partnership selection and demographically to include more women, partnership selection continues to remain highly localized. Furthermore, it is important to present methods to increase interpretability and accuracy of visual representations of data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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