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Enregistrement W4403938780 · doi:10.1101/2024.10.28.620642

Effects of organic and inorganic contaminants and their mixtures on metabolic health and gene expression in developmentally exposed zebrafish

2024· preprint· en· W4403938780 sur OpenAlexfundno aff
Roxanne Bérubé, Matthew K. LeFauve, Aicha Khalaf, Darya Aminioroomi, Christopher D. Kassotis

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueToxic Organic Pollutants Impact
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésZebrafishEnvironmental chemistryGene expressionGeneChemistryContaminationBiologyCell biologyGeneticsBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Organic and inorganic chemicals co-occur in household dust, and these chemicals have been determined to have endocrine and metabolic disrupting effects. While there is increasing study of chemical mixtures, the effects of complex mixtures mimicking household dust and other environmental matrices have not been well studied and their potential metabolism disrupting effects are thus poorly understood. Previous research has demonstrated high potency adipogenic effects of residential household dust extracts using in vitro adipogenesis assays. More recent research simplified this to a mixture relevant to household dust and comprised of common co-occurring organic and inorganic contaminants, finding that these complex combinations often exhibited additive or even synergistic effects in cell models. This study aimed to translate our previous in vitro observation to an in vivo model, the developing zebrafish, to evaluate the metabolic effects of early exposure to organic and inorganic chemicals, individually and in mixtures. Zebrafish embryos were exposed from 1 day post fertilization (dpf) to 6 dpf, then metabolic energy expenditure, swimming behavior and gene expression were measured. Globally, we observed that most mixtures did not reflect the effects of individual chemicals; the BFR mixture produced a less potent effect when compared to the individual chemicals, while the PFAS and the inorganic mixtures seemed to have a more potent effect than the individual chemicals. Finally, the environmental mixture, mimicking household dust proportions, was less potent than the inorganic chemical mix alone. Additional work is necessary to better understand the mixture effect of inorganic and organic chemicals combined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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