MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4403940362 · doi:10.7554/elife.95852.4.sa4

Author response: PUFA stabilizes a conductive state of the selectivity filter in IKs channels

2024· peer-review· en· W4403940362 sur OpenAlexaff
Alessia Golluscio, Jodene Eldstrom, Jessica J. Jowais, Marta E. Perez, Kevin P. Cunningham, Alicia de la Cruz, Xiaoan Wu, Valentina Corradi, D. Peter Tieleman, David Fedida, H. Peter Larsson

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSelectivityState (computer science)ChemistryComputer scienceAlgorithmBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Travelling through the heart are waves of electrical activity that cause muscle cells to contract and pump blood around the body. The waves are generated by charged ions which flow via tiny channels in and out of the muscle cells. This electrical activity spreads quickly from one cell to the next to make sure all the muscle cells contract at the right time. When these ion channels are compromised, this can lead to heart problems such as long QT syndrome (LQTS). In patients with LQTS, electrical activity in the heart does not follow the typical rhythm, which can result in an irregular heartbeat and lead to cardiac arrest. The most common cause of LQTS is mutations in the channel KCNQ1, which allows potassium ions to flow out of heart muscle cells. This outflux of potassium restores the electrical charge inside the cell so that it is ready to receive another electrical wave and contract at the right time. Current treatments for LQTS do not target KCNQ1 channels directly and have side effects. An alternative approach could be to use a group of molecules called polyunsaturated fatty acids (or PUFAs for short) which increase the flow of ions that pass through KCNQ1. However, it is not fully understood how PUFAs achieve this. Previous research showed that PUFAs activate KCNQ1 via two independent sites: one at the voltage sensor which decides whether the channel is open or closed (Site I), and another at the pore domain ions pass through (Site II). While it is well understood how PUFAs activate the channel at Site I, little is known about the activation mechanism that occurs at Site II. To investigate, Golluscio et al. modified egg cells from the frog Xenopus laevis to express KCNQ1 channels. Experiments investigating the electrical properties of KCNQ1 revealed that the selective filter in the pore domain – which permits potassium but no other ions to pass through – is usually unstable. However, PUFAs help to stabilize this filter, causing KCNQ1 to stay open more often and allow potassium ions to flow out of muscle cells. The findings of Golluscio et al. suggest that PUFAs could represent an important therapeutic tool to treat LQTS and potentially other cardiac disorders. However, further studies in heart cells, animals and eventually humans will be required to confirm this conclusion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,208
Score d'incertitude au seuil0,697

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0110,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2080,072

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetCardiac electrophysiology and arrhythmias→Travaux en français237 207→