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Enregistrement W4403978268 · doi:10.3390/d16110671

First Attempts at DNA Barcoding Lepidoptera in North Cyprus Reveal Unexpected Complexities in Taxonomic and Faunistic Issues

2024· article· en· W4403978268 sur OpenAlexfundno aff
Peter Huemer, Özge Özden

Notice bibliographique

RevueDiversity · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOntario GenomicsGenome Canada
Mots-clésDNA barcodingLepidoptera genitaliaBiologyGeographyEcologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fauna of Lepidoptera in the Mediterranean is still inadequately documented. As a result, even remotely complete DNA barcode libraries (mt. COI (cytochrome c oxidase 1) gene) are lacking in most areas. This proposed gap is being analyzed for the first time for the fauna of North Cyprus. In the initial phase, 248 morphospecies from 29 families (exclusive Heterocera) were sampled, sequenced and compared with existing DNA reference sequences in the global BOLD database (Barcode of Life Data Systems) via BINs (Barcode Index Numbers). A total of 194 species could be unequivocally assigned to a Linnaean taxon. Additionally, six species previously unidentified in BOLD, as well as fourteen species without reference barcodes, were identified at the species level. Twenty-four of these species were new records for Cyprus. In addition, 25 taxa with new BINs could not be assigned to a valid species due to potential cryptic diversity or the lack of relevant revisions. Furthermore, a few species could not be identified due to barcode sharing and/or potential misidentifications in BOLD. Overall, approximately 20% of the samples could not be identified using the existing DNA barcode libraries, a significant deficit for European standards, which should be addressed as a priority issue in future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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