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Enregistrement W4403999122 · doi:10.1101/2024.10.31.24316511

A Canado-European external validation of the Kidney Transplant Failure Score

2024· preprint· en· W4403999122 sur OpenAlexaffabout
Arthur Chatton, Kevin Assob Feugo, Émilie Pilote, Héloïse Cardinal, Robert W. Platt, Mireille E. Schnitzer

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKidney transplantInternal medicineMedicineKidney transplantationComputer scienceKidney

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In kidney transplantation, obtaining early information about the risk of graft failure helps physicians and patients anticipate a potential return to dialysis or retransplantation. Clinical prediction models are commonly used to obtain such risk estimation, but their performance needs to be continuously evaluated in various contexts. We propose an external validation study of the Kidney Transplant Failure Score in a pooled sample of 3,144 patients transplanted between 2010 and 2015 in France, Belgium, Norway and Canada. This score is used at the first transplantation anniversary to predict the probability of graft failure over the following seven years. The target population was defined as adult recipients of a kidney from a neurologically deceased donor without graft failure in the first year post-transplantation. Graft failure was defined as a return to dialysis. Around 10% of patients returned to dialysis, and 12.6% died during the seven-year follow-up. The KTFS authors fitted a Cox model and then adjusted its coefficients to maximize the discrimination, yielding the KTFS final version. We evaluated the performance of the initial and final versions of the KTFS, as well as the performance of another model we developed to consider death as a competing event. All KTFS versions yielded similarly good discrimination (area under the time-dependant receiver operating curve around from 0.79 [0.76-0.82] to 0.80 [0.77-0.84]), while the discrimination-optimized one presented important miscalibration. Clinical utility, assessed through net benefit, was also the lowest for the discrimination-optimized version. Our results warn against using the current KTFS version and recommend using either the initial coefficients or the competing risk-based ones instead. Lay summary French nephrologists have used the Kidney Transplant Failure Score (KTFS) for nearly fifteen years to predict kidney graft failure eight years after the transplantation. Because predictive performance decreases over time, we first verified that the score could still predict correctly in France and also in other countries. Then, we compared the different KTFS formulas to find that the one currently used is suboptimal and should be avoided. Our findings show that the KTFS is still a reliable source of information for both kidney recipients and nephrologists when using its first version.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,039
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,068
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,986
Score d'incertitude au seuil0,208

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0390,068
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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